Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

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Length 386 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxa13Q62424 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxa13Q62424 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxa13Q62424 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxa13Q62424 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxa13Q62424 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxa13Q62424 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxa13Q62424 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxa13Q62424 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxa13Q62424 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxa13Q62424 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxa13Q62424 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxa13Q62424 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxa13Q62424 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxa13Q62424 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxa13Q62424 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxa13Q62424 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxa13Q62424 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxa13Q62424 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxa13Q62424 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxa13Q62424 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxa13Q62424 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxa13Q62424 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxa13Q62424 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxa13Q62424 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxa13Q62424 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxa13Q62424 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxa13Q62424 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxa13Q62424 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxa13Q62424 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxa13Q62424 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxa13Q62424 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxa13Q62424 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxa13Q62424 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxa13Q62424 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxa13Q62424 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxa13Q62424 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxa13Q62424 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxa13Q62424 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxa13Q62424 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxa13Q62424 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxa13Q62424 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxa13Q62424 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxa13Q62424 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxa13Q62424 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxa13Q62424 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxa13Q62424 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxa13Q62424 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxa13Q62424 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxa13Q62424 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxa13Q62424 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxa13Q62424 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxa13Q62424 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxa13Q62424 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxa13Q62424 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxa13Q62424 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxa13Q62424 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxa13Q62424 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxa13Q62424 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxa13Q62424 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxa13Q62424 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxa13Q62424 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxa13Q62424 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxa13Q62424 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxa13Q62424 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxa13Q62424 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxa13Q62424 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxa13Q62424 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxa13Q62424 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxa13Q62424 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxa13Q62424 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxa13Q62424 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxa13Q62424 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxa13Q62424 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxa13Q62424 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxa13Q62424 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxa13Q62424 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxa13Q62424 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxa13Q62424 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxa13Q62424 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxa13Q62424 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxa13Q62424 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxa13Q62424 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxa13Q62424 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxa13Q62424 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxa13Q62424 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxa13Q62424 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxa13Q62424 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxa13Q62424 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxa13Q62424 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hoxa13Q62424 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hoxa13Q62424 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hoxa13Q62424 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hoxa13Q62424 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hoxa13Q62424 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hoxa13Q62424 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hoxa13Q62424 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hoxa13Q62424 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hoxa13Q62424 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hoxa13Q62424 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
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