Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sall3Q62255 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sall3Q62255 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Sall3Q62255 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sall3Q62255 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sall3Q62255 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sall3Q62255 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Sall3Q62255 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sall3Q62255 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sall3Q62255 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sall3Q62255 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sall3Q62255 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sall3Q62255 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sall3Q62255 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sall3Q62255 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sall3Q62255 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sall3Q62255 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sall3Q62255 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Sall3Q62255 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sall3Q62255 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Sall3Q62255 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sall3Q62255 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Sall3Q62255 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sall3Q62255 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sall3Q62255 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sall3Q62255 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sall3Q62255 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sall3Q62255 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sall3Q62255 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sall3Q62255 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sall3Q62255 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sall3Q62255 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sall3Q62255 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sall3Q62255 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sall3Q62255 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sall3Q62255 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sall3Q62255 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sall3Q62255 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sall3Q62255 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Sall3Q62255 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sall3Q62255 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sall3Q62255 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sall3Q62255 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sall3Q62255 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Sall3Q62255 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sall3Q62255 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sall3Q62255 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sall3Q62255 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sall3Q62255 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sall3Q62255 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sall3Q62255 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sall3Q62255 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sall3Q62255 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sall3Q62255 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sall3Q62255 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sall3Q62255 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sall3Q62255 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sall3Q62255 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sall3Q62255 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sall3Q62255 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sall3Q62255 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sall3Q62255 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sall3Q62255 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sall3Q62255 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sall3Q62255 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sall3Q62255 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sall3Q62255 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sall3Q62255 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sall3Q62255 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sall3Q62255 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sall3Q62255 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sall3Q62255 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sall3Q62255 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sall3Q62255 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sall3Q62255 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sall3Q62255 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sall3Q62255 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sall3Q62255 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Sall3Q62255 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sall3Q62255 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sall3Q62255 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sall3Q62255 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sall3Q62255 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sall3Q62255 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sall3Q62255 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sall3Q62255 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Sall3Q62255 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sall3Q62255 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sall3Q62255 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sall3Q62255 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Sall3Q62255 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sall3Q62255 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sall3Q62255 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sall3Q62255 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sall3Q62255 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sall3Q62255 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sall3Q62255 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sall3Q62255 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sall3Q62255 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sall3Q62255 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms