Protein–RNA interactions for Protein: Q62233

Six3, Homeobox protein SIX3, mousemouse

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Length 333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six3Q62233 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Six3Q62233 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Six3Q62233 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Six3Q62233 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Six3Q62233 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Six3Q62233 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Six3Q62233 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Six3Q62233 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Six3Q62233 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Six3Q62233 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Six3Q62233 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Six3Q62233 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Six3Q62233 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Six3Q62233 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Six3Q62233 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Six3Q62233 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Six3Q62233 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Six3Q62233 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Six3Q62233 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Six3Q62233 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Six3Q62233 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Six3Q62233 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Six3Q62233 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Six3Q62233 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Six3Q62233 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Six3Q62233 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Six3Q62233 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Six3Q62233 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Six3Q62233 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Six3Q62233 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Six3Q62233 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Six3Q62233 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Six3Q62233 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Six3Q62233 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Six3Q62233 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Six3Q62233 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Six3Q62233 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Six3Q62233 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Six3Q62233 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Six3Q62233 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Six3Q62233 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Six3Q62233 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Six3Q62233 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Six3Q62233 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Six3Q62233 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Six3Q62233 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Six3Q62233 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Six3Q62233 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Six3Q62233 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Six3Q62233 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Six3Q62233 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Six3Q62233 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Six3Q62233 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Six3Q62233 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Six3Q62233 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Six3Q62233 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Six3Q62233 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Six3Q62233 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Six3Q62233 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Six3Q62233 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Six3Q62233 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Six3Q62233 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Six3Q62233 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Six3Q62233 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Six3Q62233 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Six3Q62233 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Six3Q62233 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Six3Q62233 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Six3Q62233 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Six3Q62233 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Six3Q62233 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Six3Q62233 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Six3Q62233 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Six3Q62233 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Six3Q62233 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Six3Q62233 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Six3Q62233 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Six3Q62233 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Six3Q62233 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Six3Q62233 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Six3Q62233 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Six3Q62233 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Six3Q62233 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Six3Q62233 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Six3Q62233 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Six3Q62233 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Six3Q62233 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Six3Q62233 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Six3Q62233 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Six3Q62233 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Six3Q62233 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Six3Q62233 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Six3Q62233 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Six3Q62233 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Six3Q62233 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Six3Q62233 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms