Protein–RNA interactions for Protein: Q62230

Siglec1, Sialoadhesin, mousemouse

Predictions only

Length 1,695 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siglec1Q62230 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Siglec1Q62230 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Siglec1Q62230 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Siglec1Q62230 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Siglec1Q62230 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Siglec1Q62230 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Siglec1Q62230 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Siglec1Q62230 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Siglec1Q62230 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Siglec1Q62230 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Siglec1Q62230 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Siglec1Q62230 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Siglec1Q62230 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Siglec1Q62230 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Siglec1Q62230 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Siglec1Q62230 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Siglec1Q62230 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Siglec1Q62230 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Siglec1Q62230 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Siglec1Q62230 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Siglec1Q62230 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Siglec1Q62230 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Siglec1Q62230 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Siglec1Q62230 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Siglec1Q62230 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Siglec1Q62230 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Siglec1Q62230 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Siglec1Q62230 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Siglec1Q62230 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Siglec1Q62230 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Siglec1Q62230 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Siglec1Q62230 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Siglec1Q62230 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Siglec1Q62230 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Siglec1Q62230 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Siglec1Q62230 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Siglec1Q62230 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Siglec1Q62230 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Siglec1Q62230 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Siglec1Q62230 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Siglec1Q62230 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Siglec1Q62230 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Siglec1Q62230 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Siglec1Q62230 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Siglec1Q62230 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Siglec1Q62230 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Siglec1Q62230 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Siglec1Q62230 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Siglec1Q62230 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Siglec1Q62230 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Siglec1Q62230 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Siglec1Q62230 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Siglec1Q62230 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Siglec1Q62230 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
Siglec1Q62230 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Siglec1Q62230 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Siglec1Q62230 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Siglec1Q62230 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Siglec1Q62230 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Siglec1Q62230 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Siglec1Q62230 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Siglec1Q62230 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Siglec1Q62230 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Siglec1Q62230 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Siglec1Q62230 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Siglec1Q62230 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Siglec1Q62230 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Siglec1Q62230 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Siglec1Q62230 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Siglec1Q62230 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Siglec1Q62230 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Siglec1Q62230 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Siglec1Q62230 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Siglec1Q62230 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Siglec1Q62230 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Siglec1Q62230 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Siglec1Q62230 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Siglec1Q62230 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Siglec1Q62230 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Siglec1Q62230 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Siglec1Q62230 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Siglec1Q62230 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Siglec1Q62230 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Siglec1Q62230 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Siglec1Q62230 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Siglec1Q62230 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Siglec1Q62230 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Siglec1Q62230 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Siglec1Q62230 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Siglec1Q62230 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Siglec1Q62230 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Siglec1Q62230 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Siglec1Q62230 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Siglec1Q62230 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Siglec1Q62230 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Siglec1Q62230 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Siglec1Q62230 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Siglec1Q62230 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Siglec1Q62230 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Siglec1Q62230 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms