Protein–RNA interactions for Protein: Q62158

Trim27, Zinc finger protein RFP, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim27Q62158 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trim27Q62158 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trim27Q62158 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trim27Q62158 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trim27Q62158 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trim27Q62158 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trim27Q62158 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trim27Q62158 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
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Trim27Q62158 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim27Q62158 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim27Q62158 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim27Q62158 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
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Trim27Q62158 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim27Q62158 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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Trim27Q62158 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim27Q62158 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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Trim27Q62158 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
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Trim27Q62158 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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Trim27Q62158 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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Trim27Q62158 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
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Trim27Q62158 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim27Q62158 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim27Q62158 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim27Q62158 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trim27Q62158 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trim27Q62158 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trim27Q62158 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
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Trim27Q62158 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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Trim27Q62158 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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Trim27Q62158 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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Trim27Q62158 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trim27Q62158 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trim27Q62158 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trim27Q62158 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trim27Q62158 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trim27Q62158 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Trim27Q62158 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trim27Q62158 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trim27Q62158 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trim27Q62158 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trim27Q62158 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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Trim27Q62158 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trim27Q62158 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trim27Q62158 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trim27Q62158 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trim27Q62158 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trim27Q62158 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
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