Protein–RNA interactions for Protein: Q62132

Ptprr, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprrQ62132 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtprrQ62132 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtprrQ62132 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtprrQ62132 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtprrQ62132 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtprrQ62132 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtprrQ62132 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
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PtprrQ62132 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtprrQ62132 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PtprrQ62132 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtprrQ62132 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtprrQ62132 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtprrQ62132 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PtprrQ62132 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtprrQ62132 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
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PtprrQ62132 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtprrQ62132 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtprrQ62132 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtprrQ62132 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtprrQ62132 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtprrQ62132 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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PtprrQ62132 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
PtprrQ62132 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
PtprrQ62132 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PtprrQ62132 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PtprrQ62132 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PtprrQ62132 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PtprrQ62132 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PtprrQ62132 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PtprrQ62132 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PtprrQ62132 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PtprrQ62132 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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PtprrQ62132 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PtprrQ62132 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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PtprrQ62132 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PtprrQ62132 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PtprrQ62132 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PtprrQ62132 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtprrQ62132 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtprrQ62132 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtprrQ62132 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
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PtprrQ62132 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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PtprrQ62132 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtprrQ62132 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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PtprrQ62132 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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PtprrQ62132 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtprrQ62132 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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PtprrQ62132 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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PtprrQ62132 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtprrQ62132 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtprrQ62132 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtprrQ62132 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtprrQ62132 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtprrQ62132 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtprrQ62132 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtprrQ62132 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtprrQ62132 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PtprrQ62132 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtprrQ62132 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtprrQ62132 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtprrQ62132 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtprrQ62132 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
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PtprrQ62132 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PtprrQ62132 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtprrQ62132 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtprrQ62132 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtprrQ62132 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtprrQ62132 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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