Protein–RNA interactions for Protein: Q61735

Cd47, Leukocyte surface antigen CD47, mousemouse

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Length 303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd47Q61735 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cd47Q61735 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cd47Q61735 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cd47Q61735 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cd47Q61735 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cd47Q61735 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cd47Q61735 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cd47Q61735 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cd47Q61735 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cd47Q61735 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cd47Q61735 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cd47Q61735 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cd47Q61735 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cd47Q61735 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cd47Q61735 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cd47Q61735 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cd47Q61735 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cd47Q61735 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cd47Q61735 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cd47Q61735 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cd47Q61735 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cd47Q61735 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cd47Q61735 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cd47Q61735 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Cd47Q61735 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cd47Q61735 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cd47Q61735 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cd47Q61735 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cd47Q61735 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cd47Q61735 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cd47Q61735 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cd47Q61735 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cd47Q61735 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cd47Q61735 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Cd47Q61735 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cd47Q61735 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cd47Q61735 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cd47Q61735 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Cd47Q61735 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cd47Q61735 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Cd47Q61735 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cd47Q61735 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Cd47Q61735 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cd47Q61735 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cd47Q61735 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cd47Q61735 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cd47Q61735 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cd47Q61735 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cd47Q61735 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cd47Q61735 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cd47Q61735 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cd47Q61735 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cd47Q61735 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cd47Q61735 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cd47Q61735 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cd47Q61735 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cd47Q61735 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cd47Q61735 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cd47Q61735 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cd47Q61735 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cd47Q61735 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cd47Q61735 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cd47Q61735 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cd47Q61735 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Cd47Q61735 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cd47Q61735 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Cd47Q61735 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Cd47Q61735 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cd47Q61735 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cd47Q61735 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cd47Q61735 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cd47Q61735 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cd47Q61735 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cd47Q61735 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cd47Q61735 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cd47Q61735 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cd47Q61735 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cd47Q61735 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cd47Q61735 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cd47Q61735 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cd47Q61735 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cd47Q61735 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cd47Q61735 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cd47Q61735 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cd47Q61735 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cd47Q61735 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cd47Q61735 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cd47Q61735 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cd47Q61735 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cd47Q61735 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cd47Q61735 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cd47Q61735 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cd47Q61735 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cd47Q61735 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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