Protein–RNA interactions for Protein: Q61451

Cd53, Leukocyte surface antigen CD53, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd53Q61451 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd53Q61451 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd53Q61451 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd53Q61451 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cd53Q61451 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd53Q61451 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cd53Q61451 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd53Q61451 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cd53Q61451 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cd53Q61451 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd53Q61451 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd53Q61451 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd53Q61451 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd53Q61451 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd53Q61451 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd53Q61451 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd53Q61451 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd53Q61451 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cd53Q61451 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd53Q61451 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd53Q61451 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd53Q61451 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd53Q61451 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Cd53Q61451 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd53Q61451 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cd53Q61451 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd53Q61451 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd53Q61451 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd53Q61451 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd53Q61451 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd53Q61451 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cd53Q61451 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd53Q61451 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cd53Q61451 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd53Q61451 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd53Q61451 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd53Q61451 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cd53Q61451 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cd53Q61451 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Cd53Q61451 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cd53Q61451 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cd53Q61451 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cd53Q61451 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cd53Q61451 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cd53Q61451 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cd53Q61451 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cd53Q61451 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cd53Q61451 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cd53Q61451 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cd53Q61451 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cd53Q61451 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cd53Q61451 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd53Q61451 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd53Q61451 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd53Q61451 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cd53Q61451 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cd53Q61451 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cd53Q61451 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd53Q61451 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cd53Q61451 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd53Q61451 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd53Q61451 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd53Q61451 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd53Q61451 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd53Q61451 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd53Q61451 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd53Q61451 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd53Q61451 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cd53Q61451 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cd53Q61451 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd53Q61451 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cd53Q61451 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cd53Q61451 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd53Q61451 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd53Q61451 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd53Q61451 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd53Q61451 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd53Q61451 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd53Q61451 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd53Q61451 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd53Q61451 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd53Q61451 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd53Q61451 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd53Q61451 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd53Q61451 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd53Q61451 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd53Q61451 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd53Q61451 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd53Q61451 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Cd53Q61451 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd53Q61451 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd53Q61451 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd53Q61451 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cd53Q61451 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd53Q61451 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cd53Q61451 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Cd53Q61451 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Cd53Q61451 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Cd53Q61451 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Cd53Q61451 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms