Protein–RNA interactions for Protein: Q61164

Ctcf, Transcriptional repressor CTCF, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcfQ61164 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CtcfQ61164 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CtcfQ61164 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CtcfQ61164 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CtcfQ61164 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CtcfQ61164 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CtcfQ61164 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CtcfQ61164 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CtcfQ61164 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CtcfQ61164 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CtcfQ61164 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CtcfQ61164 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CtcfQ61164 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CtcfQ61164 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CtcfQ61164 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CtcfQ61164 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CtcfQ61164 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CtcfQ61164 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CtcfQ61164 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CtcfQ61164 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CtcfQ61164 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CtcfQ61164 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CtcfQ61164 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CtcfQ61164 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CtcfQ61164 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CtcfQ61164 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CtcfQ61164 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CtcfQ61164 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CtcfQ61164 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CtcfQ61164 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CtcfQ61164 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CtcfQ61164 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CtcfQ61164 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CtcfQ61164 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CtcfQ61164 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CtcfQ61164 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CtcfQ61164 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CtcfQ61164 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CtcfQ61164 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CtcfQ61164 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CtcfQ61164 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CtcfQ61164 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CtcfQ61164 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CtcfQ61164 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CtcfQ61164 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CtcfQ61164 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CtcfQ61164 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CtcfQ61164 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CtcfQ61164 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CtcfQ61164 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CtcfQ61164 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CtcfQ61164 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CtcfQ61164 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CtcfQ61164 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CtcfQ61164 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CtcfQ61164 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CtcfQ61164 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CtcfQ61164 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CtcfQ61164 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CtcfQ61164 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CtcfQ61164 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CtcfQ61164 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CtcfQ61164 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CtcfQ61164 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CtcfQ61164 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CtcfQ61164 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CtcfQ61164 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CtcfQ61164 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CtcfQ61164 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CtcfQ61164 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CtcfQ61164 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CtcfQ61164 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CtcfQ61164 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CtcfQ61164 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CtcfQ61164 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CtcfQ61164 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CtcfQ61164 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CtcfQ61164 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CtcfQ61164 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CtcfQ61164 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CtcfQ61164 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CtcfQ61164 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CtcfQ61164 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CtcfQ61164 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CtcfQ61164 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CtcfQ61164 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CtcfQ61164 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CtcfQ61164 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CtcfQ61164 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CtcfQ61164 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CtcfQ61164 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CtcfQ61164 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CtcfQ61164 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CtcfQ61164 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CtcfQ61164 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CtcfQ61164 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CtcfQ61164 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CtcfQ61164 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CtcfQ61164 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CtcfQ61164 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms