Protein–RNA interactions for Protein: Q60846

Tnfrsf8, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 8, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf8Q60846 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf8Q60846 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf8Q60846 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf8Q60846 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf8Q60846 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf8Q60846 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf8Q60846 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf8Q60846 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf8Q60846 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf8Q60846 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf8Q60846 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf8Q60846 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tnfrsf8Q60846 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tnfrsf8Q60846 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tnfrsf8Q60846 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tnfrsf8Q60846 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tnfrsf8Q60846 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tnfrsf8Q60846 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tnfrsf8Q60846 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tnfrsf8Q60846 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tnfrsf8Q60846 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfrsf8Q60846 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfrsf8Q60846 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfrsf8Q60846 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfrsf8Q60846 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfrsf8Q60846 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfrsf8Q60846 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfrsf8Q60846 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfrsf8Q60846 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfrsf8Q60846 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfrsf8Q60846 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfrsf8Q60846 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfrsf8Q60846 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfrsf8Q60846 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfrsf8Q60846 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfrsf8Q60846 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfrsf8Q60846 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfrsf8Q60846 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfrsf8Q60846 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfrsf8Q60846 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfrsf8Q60846 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfrsf8Q60846 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfrsf8Q60846 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfrsf8Q60846 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfrsf8Q60846 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfrsf8Q60846 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfrsf8Q60846 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfrsf8Q60846 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfrsf8Q60846 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfrsf8Q60846 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfrsf8Q60846 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfrsf8Q60846 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfrsf8Q60846 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfrsf8Q60846 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfrsf8Q60846 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfrsf8Q60846 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfrsf8Q60846 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfrsf8Q60846 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfrsf8Q60846 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfrsf8Q60846 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfrsf8Q60846 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfrsf8Q60846 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfrsf8Q60846 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfrsf8Q60846 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfrsf8Q60846 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfrsf8Q60846 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfrsf8Q60846 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfrsf8Q60846 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfrsf8Q60846 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfrsf8Q60846 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfrsf8Q60846 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfrsf8Q60846 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfrsf8Q60846 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfrsf8Q60846 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfrsf8Q60846 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfrsf8Q60846 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfrsf8Q60846 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfrsf8Q60846 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfrsf8Q60846 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfrsf8Q60846 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfrsf8Q60846 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfrsf8Q60846 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfrsf8Q60846 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfrsf8Q60846 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfrsf8Q60846 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfrsf8Q60846 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfrsf8Q60846 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfrsf8Q60846 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfrsf8Q60846 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfrsf8Q60846 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfrsf8Q60846 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfrsf8Q60846 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfrsf8Q60846 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfrsf8Q60846 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfrsf8Q60846 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfrsf8Q60846 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfrsf8Q60846 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfrsf8Q60846 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfrsf8Q60846 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfrsf8Q60846 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms