Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sin3aQ60520 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sin3aQ60520 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sin3aQ60520 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sin3aQ60520 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sin3aQ60520 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sin3aQ60520 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sin3aQ60520 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sin3aQ60520 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sin3aQ60520 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sin3aQ60520 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sin3aQ60520 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sin3aQ60520 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sin3aQ60520 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sin3aQ60520 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sin3aQ60520 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sin3aQ60520 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sin3aQ60520 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sin3aQ60520 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sin3aQ60520 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sin3aQ60520 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sin3aQ60520 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sin3aQ60520 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sin3aQ60520 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sin3aQ60520 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sin3aQ60520 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sin3aQ60520 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sin3aQ60520 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sin3aQ60520 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sin3aQ60520 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sin3aQ60520 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sin3aQ60520 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sin3aQ60520 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sin3aQ60520 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sin3aQ60520 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sin3aQ60520 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sin3aQ60520 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sin3aQ60520 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sin3aQ60520 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sin3aQ60520 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sin3aQ60520 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sin3aQ60520 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sin3aQ60520 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sin3aQ60520 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sin3aQ60520 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sin3aQ60520 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sin3aQ60520 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sin3aQ60520 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sin3aQ60520 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Sin3aQ60520 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sin3aQ60520 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sin3aQ60520 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sin3aQ60520 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sin3aQ60520 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sin3aQ60520 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sin3aQ60520 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sin3aQ60520 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sin3aQ60520 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sin3aQ60520 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Sin3aQ60520 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sin3aQ60520 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sin3aQ60520 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sin3aQ60520 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sin3aQ60520 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sin3aQ60520 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sin3aQ60520 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Sin3aQ60520 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Sin3aQ60520 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Sin3aQ60520 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sin3aQ60520 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sin3aQ60520 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sin3aQ60520 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sin3aQ60520 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sin3aQ60520 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sin3aQ60520 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sin3aQ60520 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sin3aQ60520 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sin3aQ60520 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sin3aQ60520 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sin3aQ60520 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sin3aQ60520 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sin3aQ60520 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sin3aQ60520 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sin3aQ60520 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sin3aQ60520 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sin3aQ60520 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Sin3aQ60520 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sin3aQ60520 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sin3aQ60520 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sin3aQ60520 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sin3aQ60520 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sin3aQ60520 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sin3aQ60520 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sin3aQ60520 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sin3aQ60520 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sin3aQ60520 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sin3aQ60520 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sin3aQ60520 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sin3aQ60520 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sin3aQ60520 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms