Protein–RNA interactions for Protein: Q5XG71

Utp20, Small subunit processome component 20 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,788 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp20Q5XG71 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Utp20Q5XG71 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Utp20Q5XG71 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Utp20Q5XG71 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Utp20Q5XG71 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Utp20Q5XG71 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Utp20Q5XG71 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Utp20Q5XG71 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Utp20Q5XG71 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Utp20Q5XG71 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms