Protein–RNA interactions for Protein: Q5XF89

Atp13a3, Probable cation-transporting ATPase 13A3, mousemouse

Predictions only

Length 1,219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a3Q5XF89 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp13a3Q5XF89 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp13a3Q5XF89 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp13a3Q5XF89 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp13a3Q5XF89 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp13a3Q5XF89 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp13a3Q5XF89 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Atp13a3Q5XF89 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Atp13a3Q5XF89 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Atp13a3Q5XF89 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Atp13a3Q5XF89 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Atp13a3Q5XF89 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Atp13a3Q5XF89 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atp13a3Q5XF89 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atp13a3Q5XF89 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atp13a3Q5XF89 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atp13a3Q5XF89 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atp13a3Q5XF89 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atp13a3Q5XF89 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Atp13a3Q5XF89 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Atp13a3Q5XF89 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Atp13a3Q5XF89 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atp13a3Q5XF89 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atp13a3Q5XF89 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atp13a3Q5XF89 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atp13a3Q5XF89 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atp13a3Q5XF89 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atp13a3Q5XF89 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atp13a3Q5XF89 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atp13a3Q5XF89 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atp13a3Q5XF89 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atp13a3Q5XF89 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atp13a3Q5XF89 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atp13a3Q5XF89 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atp13a3Q5XF89 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atp13a3Q5XF89 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atp13a3Q5XF89 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Atp13a3Q5XF89 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Atp13a3Q5XF89 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atp13a3Q5XF89 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atp13a3Q5XF89 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atp13a3Q5XF89 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atp13a3Q5XF89 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atp13a3Q5XF89 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Atp13a3Q5XF89 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atp13a3Q5XF89 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atp13a3Q5XF89 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atp13a3Q5XF89 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atp13a3Q5XF89 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atp13a3Q5XF89 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atp13a3Q5XF89 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atp13a3Q5XF89 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atp13a3Q5XF89 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atp13a3Q5XF89 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atp13a3Q5XF89 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atp13a3Q5XF89 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atp13a3Q5XF89 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atp13a3Q5XF89 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atp13a3Q5XF89 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atp13a3Q5XF89 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atp13a3Q5XF89 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atp13a3Q5XF89 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atp13a3Q5XF89 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atp13a3Q5XF89 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Atp13a3Q5XF89 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atp13a3Q5XF89 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atp13a3Q5XF89 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atp13a3Q5XF89 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atp13a3Q5XF89 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atp13a3Q5XF89 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atp13a3Q5XF89 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atp13a3Q5XF89 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atp13a3Q5XF89 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atp13a3Q5XF89 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atp13a3Q5XF89 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atp13a3Q5XF89 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atp13a3Q5XF89 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atp13a3Q5XF89 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atp13a3Q5XF89 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atp13a3Q5XF89 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atp13a3Q5XF89 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atp13a3Q5XF89 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Atp13a3Q5XF89 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atp13a3Q5XF89 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atp13a3Q5XF89 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atp13a3Q5XF89 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atp13a3Q5XF89 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atp13a3Q5XF89 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atp13a3Q5XF89 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atp13a3Q5XF89 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atp13a3Q5XF89 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atp13a3Q5XF89 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atp13a3Q5XF89 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atp13a3Q5XF89 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atp13a3Q5XF89 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atp13a3Q5XF89 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atp13a3Q5XF89 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atp13a3Q5XF89 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atp13a3Q5XF89 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atp13a3Q5XF89 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms