Protein–RNA interactions for Protein: Q5UW37

Cxcl17, C-X-C motif chemokine 17, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl17Q5UW37 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cxcl17Q5UW37 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cxcl17Q5UW37 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cxcl17Q5UW37 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cxcl17Q5UW37 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cxcl17Q5UW37 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cxcl17Q5UW37 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cxcl17Q5UW37 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cxcl17Q5UW37 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cxcl17Q5UW37 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cxcl17Q5UW37 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cxcl17Q5UW37 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cxcl17Q5UW37 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cxcl17Q5UW37 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cxcl17Q5UW37 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cxcl17Q5UW37 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cxcl17Q5UW37 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cxcl17Q5UW37 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cxcl17Q5UW37 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cxcl17Q5UW37 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cxcl17Q5UW37 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cxcl17Q5UW37 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cxcl17Q5UW37 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cxcl17Q5UW37 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cxcl17Q5UW37 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cxcl17Q5UW37 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cxcl17Q5UW37 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cxcl17Q5UW37 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cxcl17Q5UW37 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cxcl17Q5UW37 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cxcl17Q5UW37 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cxcl17Q5UW37 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cxcl17Q5UW37 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cxcl17Q5UW37 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cxcl17Q5UW37 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cxcl17Q5UW37 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cxcl17Q5UW37 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cxcl17Q5UW37 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cxcl17Q5UW37 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cxcl17Q5UW37 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cxcl17Q5UW37 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cxcl17Q5UW37 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cxcl17Q5UW37 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cxcl17Q5UW37 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cxcl17Q5UW37 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cxcl17Q5UW37 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cxcl17Q5UW37 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cxcl17Q5UW37 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cxcl17Q5UW37 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cxcl17Q5UW37 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cxcl17Q5UW37 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cxcl17Q5UW37 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cxcl17Q5UW37 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cxcl17Q5UW37 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cxcl17Q5UW37 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cxcl17Q5UW37 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cxcl17Q5UW37 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cxcl17Q5UW37 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cxcl17Q5UW37 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cxcl17Q5UW37 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cxcl17Q5UW37 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cxcl17Q5UW37 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cxcl17Q5UW37 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cxcl17Q5UW37 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cxcl17Q5UW37 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cxcl17Q5UW37 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cxcl17Q5UW37 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cxcl17Q5UW37 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cxcl17Q5UW37 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cxcl17Q5UW37 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cxcl17Q5UW37 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cxcl17Q5UW37 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cxcl17Q5UW37 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cxcl17Q5UW37 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cxcl17Q5UW37 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cxcl17Q5UW37 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cxcl17Q5UW37 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cxcl17Q5UW37 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cxcl17Q5UW37 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cxcl17Q5UW37 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cxcl17Q5UW37 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cxcl17Q5UW37 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cxcl17Q5UW37 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cxcl17Q5UW37 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cxcl17Q5UW37 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cxcl17Q5UW37 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cxcl17Q5UW37 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cxcl17Q5UW37 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cxcl17Q5UW37 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cxcl17Q5UW37 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cxcl17Q5UW37 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cxcl17Q5UW37 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cxcl17Q5UW37 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cxcl17Q5UW37 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cxcl17Q5UW37 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cxcl17Q5UW37 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cxcl17Q5UW37 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cxcl17Q5UW37 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cxcl17Q5UW37 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cxcl17Q5UW37 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.5 ms