Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4C3

Scaf1, Splicing factor, arginine/serine-rich 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf1Q5U4C3 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Scaf1Q5U4C3 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Scaf1Q5U4C3 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Scaf1Q5U4C3 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Scaf1Q5U4C3 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Scaf1Q5U4C3 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Scaf1Q5U4C3 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Scaf1Q5U4C3 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Scaf1Q5U4C3 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Scaf1Q5U4C3 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Scaf1Q5U4C3 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Scaf1Q5U4C3 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Scaf1Q5U4C3 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Scaf1Q5U4C3 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Scaf1Q5U4C3 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Scaf1Q5U4C3 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Scaf1Q5U4C3 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Scaf1Q5U4C3 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Scaf1Q5U4C3 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Scaf1Q5U4C3 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Scaf1Q5U4C3 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Scaf1Q5U4C3 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Scaf1Q5U4C3 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Scaf1Q5U4C3 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Scaf1Q5U4C3 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Scaf1Q5U4C3 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Scaf1Q5U4C3 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Scaf1Q5U4C3 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Scaf1Q5U4C3 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Scaf1Q5U4C3 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Scaf1Q5U4C3 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Scaf1Q5U4C3 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Scaf1Q5U4C3 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Scaf1Q5U4C3 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Scaf1Q5U4C3 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Scaf1Q5U4C3 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Scaf1Q5U4C3 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Scaf1Q5U4C3 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Scaf1Q5U4C3 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Scaf1Q5U4C3 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Scaf1Q5U4C3 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Scaf1Q5U4C3 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Scaf1Q5U4C3 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Scaf1Q5U4C3 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Scaf1Q5U4C3 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Scaf1Q5U4C3 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Scaf1Q5U4C3 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Scaf1Q5U4C3 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Scaf1Q5U4C3 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Scaf1Q5U4C3 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Scaf1Q5U4C3 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scaf1Q5U4C3 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scaf1Q5U4C3 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scaf1Q5U4C3 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scaf1Q5U4C3 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scaf1Q5U4C3 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scaf1Q5U4C3 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scaf1Q5U4C3 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scaf1Q5U4C3 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scaf1Q5U4C3 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scaf1Q5U4C3 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scaf1Q5U4C3 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scaf1Q5U4C3 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Scaf1Q5U4C3 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scaf1Q5U4C3 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scaf1Q5U4C3 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scaf1Q5U4C3 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scaf1Q5U4C3 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scaf1Q5U4C3 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scaf1Q5U4C3 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scaf1Q5U4C3 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Scaf1Q5U4C3 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Scaf1Q5U4C3 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Scaf1Q5U4C3 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Scaf1Q5U4C3 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Scaf1Q5U4C3 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Scaf1Q5U4C3 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Scaf1Q5U4C3 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Scaf1Q5U4C3 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Scaf1Q5U4C3 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Scaf1Q5U4C3 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Scaf1Q5U4C3 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Scaf1Q5U4C3 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Scaf1Q5U4C3 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Scaf1Q5U4C3 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Scaf1Q5U4C3 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Scaf1Q5U4C3 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Scaf1Q5U4C3 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Scaf1Q5U4C3 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Scaf1Q5U4C3 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Scaf1Q5U4C3 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Scaf1Q5U4C3 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Scaf1Q5U4C3 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Scaf1Q5U4C3 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Scaf1Q5U4C3 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Scaf1Q5U4C3 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Scaf1Q5U4C3 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Scaf1Q5U4C3 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Scaf1Q5U4C3 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Scaf1Q5U4C3 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1432.1 ms