Protein–RNA interactions for Protein: Q5U465

Ccdc125, Coiled-coil domain-containing protein 125, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc125Q5U465 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc125Q5U465 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc125Q5U465 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc125Q5U465 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc125Q5U465 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc125Q5U465 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc125Q5U465 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc125Q5U465 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc125Q5U465 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc125Q5U465 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc125Q5U465 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc125Q5U465 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc125Q5U465 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc125Q5U465 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc125Q5U465 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc125Q5U465 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc125Q5U465 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc125Q5U465 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc125Q5U465 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc125Q5U465 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc125Q5U465 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc125Q5U465 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc125Q5U465 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc125Q5U465 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc125Q5U465 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc125Q5U465 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc125Q5U465 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc125Q5U465 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc125Q5U465 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc125Q5U465 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc125Q5U465 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc125Q5U465 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc125Q5U465 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc125Q5U465 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc125Q5U465 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc125Q5U465 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc125Q5U465 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc125Q5U465 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc125Q5U465 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc125Q5U465 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc125Q5U465 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc125Q5U465 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc125Q5U465 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc125Q5U465 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc125Q5U465 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc125Q5U465 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc125Q5U465 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc125Q5U465 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc125Q5U465 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc125Q5U465 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc125Q5U465 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc125Q5U465 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc125Q5U465 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc125Q5U465 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc125Q5U465 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc125Q5U465 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc125Q5U465 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc125Q5U465 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc125Q5U465 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc125Q5U465 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc125Q5U465 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc125Q5U465 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc125Q5U465 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc125Q5U465 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc125Q5U465 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc125Q5U465 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc125Q5U465 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc125Q5U465 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc125Q5U465 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc125Q5U465 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc125Q5U465 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc125Q5U465 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc125Q5U465 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc125Q5U465 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc125Q5U465 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc125Q5U465 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc125Q5U465 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc125Q5U465 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc125Q5U465 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc125Q5U465 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc125Q5U465 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc125Q5U465 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc125Q5U465 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc125Q5U465 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc125Q5U465 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc125Q5U465 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc125Q5U465 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc125Q5U465 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc125Q5U465 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc125Q5U465 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc125Q5U465 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc125Q5U465 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc125Q5U465 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc125Q5U465 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc125Q5U465 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc125Q5U465 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc125Q5U465 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc125Q5U465 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc125Q5U465 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc125Q5U465 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms