Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUE8

Ankrd40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd40Q5SUE8 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ankrd40Q5SUE8 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ankrd40Q5SUE8 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ankrd40Q5SUE8 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ankrd40Q5SUE8 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ankrd40Q5SUE8 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ankrd40Q5SUE8 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ankrd40Q5SUE8 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ankrd40Q5SUE8 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ankrd40Q5SUE8 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ankrd40Q5SUE8 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ankrd40Q5SUE8 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ankrd40Q5SUE8 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ankrd40Q5SUE8 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ankrd40Q5SUE8 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ankrd40Q5SUE8 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ankrd40Q5SUE8 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ankrd40Q5SUE8 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ankrd40Q5SUE8 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ankrd40Q5SUE8 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ankrd40Q5SUE8 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ankrd40Q5SUE8 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ankrd40Q5SUE8 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ankrd40Q5SUE8 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ankrd40Q5SUE8 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ankrd40Q5SUE8 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ankrd40Q5SUE8 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ankrd40Q5SUE8 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ankrd40Q5SUE8 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ankrd40Q5SUE8 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ankrd40Q5SUE8 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ankrd40Q5SUE8 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ankrd40Q5SUE8 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ankrd40Q5SUE8 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ankrd40Q5SUE8 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ankrd40Q5SUE8 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ankrd40Q5SUE8 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ankrd40Q5SUE8 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ankrd40Q5SUE8 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ankrd40Q5SUE8 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ankrd40Q5SUE8 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ankrd40Q5SUE8 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ankrd40Q5SUE8 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ankrd40Q5SUE8 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ankrd40Q5SUE8 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ankrd40Q5SUE8 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ankrd40Q5SUE8 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ankrd40Q5SUE8 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ankrd40Q5SUE8 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ankrd40Q5SUE8 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ankrd40Q5SUE8 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ankrd40Q5SUE8 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ankrd40Q5SUE8 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ankrd40Q5SUE8 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ankrd40Q5SUE8 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ankrd40Q5SUE8 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ankrd40Q5SUE8 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ankrd40Q5SUE8 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ankrd40Q5SUE8 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ankrd40Q5SUE8 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ankrd40Q5SUE8 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ankrd40Q5SUE8 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ankrd40Q5SUE8 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ankrd40Q5SUE8 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ankrd40Q5SUE8 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ankrd40Q5SUE8 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ankrd40Q5SUE8 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ankrd40Q5SUE8 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ankrd40Q5SUE8 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ankrd40Q5SUE8 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ankrd40Q5SUE8 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ankrd40Q5SUE8 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ankrd40Q5SUE8 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ankrd40Q5SUE8 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ankrd40Q5SUE8 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ankrd40Q5SUE8 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ankrd40Q5SUE8 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ankrd40Q5SUE8 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ankrd40Q5SUE8 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ankrd40Q5SUE8 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ankrd40Q5SUE8 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ankrd40Q5SUE8 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ankrd40Q5SUE8 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ankrd40Q5SUE8 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ankrd40Q5SUE8 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ankrd40Q5SUE8 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ankrd40Q5SUE8 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ankrd40Q5SUE8 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ankrd40Q5SUE8 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ankrd40Q5SUE8 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ankrd40Q5SUE8 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ankrd40Q5SUE8 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ankrd40Q5SUE8 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ankrd40Q5SUE8 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ankrd40Q5SUE8 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ankrd40Q5SUE8 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ankrd40Q5SUE8 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ankrd40Q5SUE8 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Ankrd40Q5SUE8 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ankrd40Q5SUE8 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms