Protein–RNA interactions for Protein: Q5STT6

Fam71b, Protein FAM71B, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71bQ5STT6 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam71bQ5STT6 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam71bQ5STT6 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam71bQ5STT6 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam71bQ5STT6 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam71bQ5STT6 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam71bQ5STT6 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam71bQ5STT6 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam71bQ5STT6 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam71bQ5STT6 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam71bQ5STT6 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam71bQ5STT6 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam71bQ5STT6 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam71bQ5STT6 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam71bQ5STT6 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam71bQ5STT6 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam71bQ5STT6 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam71bQ5STT6 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam71bQ5STT6 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam71bQ5STT6 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam71bQ5STT6 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam71bQ5STT6 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam71bQ5STT6 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam71bQ5STT6 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam71bQ5STT6 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam71bQ5STT6 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam71bQ5STT6 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam71bQ5STT6 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam71bQ5STT6 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam71bQ5STT6 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam71bQ5STT6 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam71bQ5STT6 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam71bQ5STT6 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam71bQ5STT6 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam71bQ5STT6 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam71bQ5STT6 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam71bQ5STT6 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam71bQ5STT6 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam71bQ5STT6 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam71bQ5STT6 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam71bQ5STT6 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam71bQ5STT6 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam71bQ5STT6 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam71bQ5STT6 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam71bQ5STT6 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam71bQ5STT6 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam71bQ5STT6 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam71bQ5STT6 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam71bQ5STT6 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam71bQ5STT6 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam71bQ5STT6 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam71bQ5STT6 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam71bQ5STT6 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam71bQ5STT6 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam71bQ5STT6 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam71bQ5STT6 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam71bQ5STT6 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam71bQ5STT6 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam71bQ5STT6 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam71bQ5STT6 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam71bQ5STT6 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam71bQ5STT6 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam71bQ5STT6 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam71bQ5STT6 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam71bQ5STT6 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam71bQ5STT6 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam71bQ5STT6 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fam71bQ5STT6 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fam71bQ5STT6 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fam71bQ5STT6 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fam71bQ5STT6 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam71bQ5STT6 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam71bQ5STT6 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam71bQ5STT6 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam71bQ5STT6 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam71bQ5STT6 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam71bQ5STT6 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam71bQ5STT6 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam71bQ5STT6 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam71bQ5STT6 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam71bQ5STT6 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam71bQ5STT6 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam71bQ5STT6 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam71bQ5STT6 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam71bQ5STT6 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam71bQ5STT6 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam71bQ5STT6 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam71bQ5STT6 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam71bQ5STT6 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam71bQ5STT6 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam71bQ5STT6 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam71bQ5STT6 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam71bQ5STT6 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam71bQ5STT6 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam71bQ5STT6 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam71bQ5STT6 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam71bQ5STT6 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam71bQ5STT6 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam71bQ5STT6 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam71bQ5STT6 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms