Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sft2d1Q5SSN7 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sft2d1Q5SSN7 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sft2d1Q5SSN7 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sft2d1Q5SSN7 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sft2d1Q5SSN7 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sft2d1Q5SSN7 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sft2d1Q5SSN7 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sft2d1Q5SSN7 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sft2d1Q5SSN7 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sft2d1Q5SSN7 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sft2d1Q5SSN7 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sft2d1Q5SSN7 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sft2d1Q5SSN7 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sft2d1Q5SSN7 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sft2d1Q5SSN7 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sft2d1Q5SSN7 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Sft2d1Q5SSN7 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sft2d1Q5SSN7 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Sft2d1Q5SSN7 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sft2d1Q5SSN7 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sft2d1Q5SSN7 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sft2d1Q5SSN7 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sft2d1Q5SSN7 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sft2d1Q5SSN7 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sft2d1Q5SSN7 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sft2d1Q5SSN7 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sft2d1Q5SSN7 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sft2d1Q5SSN7 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sft2d1Q5SSN7 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sft2d1Q5SSN7 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sft2d1Q5SSN7 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sft2d1Q5SSN7 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sft2d1Q5SSN7 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sft2d1Q5SSN7 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sft2d1Q5SSN7 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sft2d1Q5SSN7 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sft2d1Q5SSN7 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sft2d1Q5SSN7 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sft2d1Q5SSN7 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sft2d1Q5SSN7 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sft2d1Q5SSN7 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sft2d1Q5SSN7 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sft2d1Q5SSN7 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sft2d1Q5SSN7 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sft2d1Q5SSN7 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sft2d1Q5SSN7 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sft2d1Q5SSN7 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sft2d1Q5SSN7 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Sft2d1Q5SSN7 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sft2d1Q5SSN7 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sft2d1Q5SSN7 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sft2d1Q5SSN7 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sft2d1Q5SSN7 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sft2d1Q5SSN7 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sft2d1Q5SSN7 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sft2d1Q5SSN7 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sft2d1Q5SSN7 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sft2d1Q5SSN7 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sft2d1Q5SSN7 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sft2d1Q5SSN7 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sft2d1Q5SSN7 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sft2d1Q5SSN7 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sft2d1Q5SSN7 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sft2d1Q5SSN7 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Sft2d1Q5SSN7 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Sft2d1Q5SSN7 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sft2d1Q5SSN7 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sft2d1Q5SSN7 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sft2d1Q5SSN7 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sft2d1Q5SSN7 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sft2d1Q5SSN7 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sft2d1Q5SSN7 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sft2d1Q5SSN7 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sft2d1Q5SSN7 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sft2d1Q5SSN7 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sft2d1Q5SSN7 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sft2d1Q5SSN7 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sft2d1Q5SSN7 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Sft2d1Q5SSN7 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sft2d1Q5SSN7 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sft2d1Q5SSN7 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sft2d1Q5SSN7 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sft2d1Q5SSN7 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sft2d1Q5SSN7 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sft2d1Q5SSN7 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sft2d1Q5SSN7 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sft2d1Q5SSN7 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sft2d1Q5SSN7 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sft2d1Q5SSN7 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sft2d1Q5SSN7 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sft2d1Q5SSN7 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sft2d1Q5SSN7 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sft2d1Q5SSN7 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sft2d1Q5SSN7 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sft2d1Q5SSN7 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sft2d1Q5SSN7 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sft2d1Q5SSN7 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms