Protein–RNA interactions for Protein: Q5ND28

Scarf1, Scavenger receptor class F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf1Q5ND28 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scarf1Q5ND28 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scarf1Q5ND28 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Scarf1Q5ND28 D530018E20Rik-201ENSMUST00000205107 958 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Scarf1Q5ND28 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Scarf1Q5ND28 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scarf1Q5ND28 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scarf1Q5ND28 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scarf1Q5ND28 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scarf1Q5ND28 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scarf1Q5ND28 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scarf1Q5ND28 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scarf1Q5ND28 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scarf1Q5ND28 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scarf1Q5ND28 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scarf1Q5ND28 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scarf1Q5ND28 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scarf1Q5ND28 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scarf1Q5ND28 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scarf1Q5ND28 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scarf1Q5ND28 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scarf1Q5ND28 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scarf1Q5ND28 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scarf1Q5ND28 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scarf1Q5ND28 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scarf1Q5ND28 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scarf1Q5ND28 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scarf1Q5ND28 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scarf1Q5ND28 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scarf1Q5ND28 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scarf1Q5ND28 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scarf1Q5ND28 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scarf1Q5ND28 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scarf1Q5ND28 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scarf1Q5ND28 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scarf1Q5ND28 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scarf1Q5ND28 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scarf1Q5ND28 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Scarf1Q5ND28 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scarf1Q5ND28 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scarf1Q5ND28 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scarf1Q5ND28 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scarf1Q5ND28 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scarf1Q5ND28 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scarf1Q5ND28 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scarf1Q5ND28 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scarf1Q5ND28 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Scarf1Q5ND28 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scarf1Q5ND28 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scarf1Q5ND28 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scarf1Q5ND28 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scarf1Q5ND28 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scarf1Q5ND28 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Scarf1Q5ND28 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Scarf1Q5ND28 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Scarf1Q5ND28 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Scarf1Q5ND28 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Scarf1Q5ND28 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Scarf1Q5ND28 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Scarf1Q5ND28 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Scarf1Q5ND28 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Scarf1Q5ND28 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Scarf1Q5ND28 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Scarf1Q5ND28 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Scarf1Q5ND28 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Scarf1Q5ND28 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Scarf1Q5ND28 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Scarf1Q5ND28 Gm38134-201ENSMUST00000191858 1234 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Scarf1Q5ND28 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Scarf1Q5ND28 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Scarf1Q5ND28 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Scarf1Q5ND28 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Scarf1Q5ND28 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Scarf1Q5ND28 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Scarf1Q5ND28 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Scarf1Q5ND28 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Scarf1Q5ND28 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scarf1Q5ND28 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scarf1Q5ND28 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scarf1Q5ND28 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scarf1Q5ND28 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scarf1Q5ND28 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scarf1Q5ND28 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scarf1Q5ND28 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scarf1Q5ND28 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scarf1Q5ND28 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scarf1Q5ND28 4933401J01Rik-201ENSMUST00000193812 1070 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Scarf1Q5ND28 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scarf1Q5ND28 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scarf1Q5ND28 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scarf1Q5ND28 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scarf1Q5ND28 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scarf1Q5ND28 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scarf1Q5ND28 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Scarf1Q5ND28 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scarf1Q5ND28 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scarf1Q5ND28 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scarf1Q5ND28 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scarf1Q5ND28 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scarf1Q5ND28 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms