Protein–RNA interactions for Protein: Q5HZJ0

Drosha, Ribonuclease 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DroshaQ5HZJ0 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DroshaQ5HZJ0 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DroshaQ5HZJ0 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DroshaQ5HZJ0 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DroshaQ5HZJ0 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DroshaQ5HZJ0 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
DroshaQ5HZJ0 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DroshaQ5HZJ0 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
DroshaQ5HZJ0 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DroshaQ5HZJ0 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DroshaQ5HZJ0 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
DroshaQ5HZJ0 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DroshaQ5HZJ0 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DroshaQ5HZJ0 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DroshaQ5HZJ0 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
DroshaQ5HZJ0 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DroshaQ5HZJ0 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DroshaQ5HZJ0 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DroshaQ5HZJ0 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DroshaQ5HZJ0 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DroshaQ5HZJ0 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DroshaQ5HZJ0 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DroshaQ5HZJ0 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DroshaQ5HZJ0 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DroshaQ5HZJ0 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DroshaQ5HZJ0 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DroshaQ5HZJ0 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
DroshaQ5HZJ0 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DroshaQ5HZJ0 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DroshaQ5HZJ0 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DroshaQ5HZJ0 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DroshaQ5HZJ0 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DroshaQ5HZJ0 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DroshaQ5HZJ0 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DroshaQ5HZJ0 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DroshaQ5HZJ0 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
DroshaQ5HZJ0 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DroshaQ5HZJ0 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DroshaQ5HZJ0 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DroshaQ5HZJ0 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DroshaQ5HZJ0 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DroshaQ5HZJ0 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DroshaQ5HZJ0 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DroshaQ5HZJ0 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
DroshaQ5HZJ0 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
DroshaQ5HZJ0 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
DroshaQ5HZJ0 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
DroshaQ5HZJ0 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
DroshaQ5HZJ0 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
DroshaQ5HZJ0 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
DroshaQ5HZJ0 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
DroshaQ5HZJ0 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
DroshaQ5HZJ0 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
DroshaQ5HZJ0 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DroshaQ5HZJ0 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
DroshaQ5HZJ0 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DroshaQ5HZJ0 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DroshaQ5HZJ0 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DroshaQ5HZJ0 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DroshaQ5HZJ0 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
DroshaQ5HZJ0 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DroshaQ5HZJ0 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DroshaQ5HZJ0 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DroshaQ5HZJ0 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DroshaQ5HZJ0 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DroshaQ5HZJ0 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DroshaQ5HZJ0 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DroshaQ5HZJ0 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DroshaQ5HZJ0 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DroshaQ5HZJ0 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DroshaQ5HZJ0 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DroshaQ5HZJ0 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DroshaQ5HZJ0 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DroshaQ5HZJ0 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DroshaQ5HZJ0 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DroshaQ5HZJ0 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DroshaQ5HZJ0 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
DroshaQ5HZJ0 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DroshaQ5HZJ0 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DroshaQ5HZJ0 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DroshaQ5HZJ0 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DroshaQ5HZJ0 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DroshaQ5HZJ0 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DroshaQ5HZJ0 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DroshaQ5HZJ0 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
DroshaQ5HZJ0 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DroshaQ5HZJ0 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DroshaQ5HZJ0 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DroshaQ5HZJ0 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
DroshaQ5HZJ0 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DroshaQ5HZJ0 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DroshaQ5HZJ0 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DroshaQ5HZJ0 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DroshaQ5HZJ0 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DroshaQ5HZJ0 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DroshaQ5HZJ0 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DroshaQ5HZJ0 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DroshaQ5HZJ0 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DroshaQ5HZJ0 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DroshaQ5HZJ0 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms