Protein–RNA interactions for Protein: Q5G5D5

Syna, Syncytin-A, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynaQ5G5D5 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SynaQ5G5D5 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SynaQ5G5D5 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SynaQ5G5D5 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SynaQ5G5D5 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SynaQ5G5D5 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SynaQ5G5D5 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SynaQ5G5D5 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SynaQ5G5D5 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SynaQ5G5D5 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SynaQ5G5D5 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SynaQ5G5D5 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SynaQ5G5D5 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SynaQ5G5D5 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SynaQ5G5D5 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SynaQ5G5D5 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SynaQ5G5D5 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SynaQ5G5D5 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SynaQ5G5D5 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SynaQ5G5D5 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SynaQ5G5D5 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SynaQ5G5D5 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SynaQ5G5D5 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SynaQ5G5D5 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SynaQ5G5D5 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SynaQ5G5D5 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SynaQ5G5D5 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SynaQ5G5D5 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SynaQ5G5D5 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SynaQ5G5D5 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SynaQ5G5D5 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SynaQ5G5D5 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SynaQ5G5D5 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SynaQ5G5D5 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SynaQ5G5D5 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SynaQ5G5D5 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SynaQ5G5D5 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SynaQ5G5D5 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SynaQ5G5D5 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SynaQ5G5D5 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SynaQ5G5D5 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SynaQ5G5D5 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SynaQ5G5D5 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SynaQ5G5D5 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SynaQ5G5D5 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SynaQ5G5D5 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SynaQ5G5D5 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SynaQ5G5D5 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SynaQ5G5D5 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SynaQ5G5D5 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SynaQ5G5D5 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SynaQ5G5D5 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SynaQ5G5D5 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SynaQ5G5D5 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SynaQ5G5D5 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SynaQ5G5D5 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SynaQ5G5D5 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SynaQ5G5D5 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SynaQ5G5D5 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SynaQ5G5D5 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SynaQ5G5D5 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SynaQ5G5D5 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SynaQ5G5D5 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SynaQ5G5D5 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SynaQ5G5D5 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SynaQ5G5D5 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SynaQ5G5D5 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SynaQ5G5D5 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SynaQ5G5D5 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SynaQ5G5D5 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SynaQ5G5D5 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SynaQ5G5D5 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SynaQ5G5D5 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SynaQ5G5D5 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SynaQ5G5D5 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SynaQ5G5D5 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SynaQ5G5D5 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SynaQ5G5D5 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SynaQ5G5D5 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SynaQ5G5D5 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SynaQ5G5D5 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SynaQ5G5D5 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SynaQ5G5D5 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SynaQ5G5D5 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SynaQ5G5D5 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SynaQ5G5D5 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SynaQ5G5D5 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SynaQ5G5D5 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SynaQ5G5D5 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SynaQ5G5D5 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SynaQ5G5D5 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SynaQ5G5D5 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SynaQ5G5D5 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SynaQ5G5D5 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SynaQ5G5D5 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SynaQ5G5D5 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SynaQ5G5D5 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SynaQ5G5D5 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SynaQ5G5D5 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SynaQ5G5D5 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms