Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTW2

Sfmbt2, Scm-like with four MBT domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt2Q5DTW2 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sfmbt2Q5DTW2 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sfmbt2Q5DTW2 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sfmbt2Q5DTW2 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sfmbt2Q5DTW2 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sfmbt2Q5DTW2 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sfmbt2Q5DTW2 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sfmbt2Q5DTW2 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sfmbt2Q5DTW2 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sfmbt2Q5DTW2 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sfmbt2Q5DTW2 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sfmbt2Q5DTW2 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sfmbt2Q5DTW2 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sfmbt2Q5DTW2 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sfmbt2Q5DTW2 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sfmbt2Q5DTW2 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sfmbt2Q5DTW2 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sfmbt2Q5DTW2 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sfmbt2Q5DTW2 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sfmbt2Q5DTW2 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sfmbt2Q5DTW2 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sfmbt2Q5DTW2 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sfmbt2Q5DTW2 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sfmbt2Q5DTW2 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sfmbt2Q5DTW2 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sfmbt2Q5DTW2 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sfmbt2Q5DTW2 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sfmbt2Q5DTW2 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sfmbt2Q5DTW2 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sfmbt2Q5DTW2 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sfmbt2Q5DTW2 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sfmbt2Q5DTW2 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sfmbt2Q5DTW2 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sfmbt2Q5DTW2 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sfmbt2Q5DTW2 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sfmbt2Q5DTW2 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sfmbt2Q5DTW2 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sfmbt2Q5DTW2 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sfmbt2Q5DTW2 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sfmbt2Q5DTW2 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sfmbt2Q5DTW2 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sfmbt2Q5DTW2 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sfmbt2Q5DTW2 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sfmbt2Q5DTW2 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sfmbt2Q5DTW2 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sfmbt2Q5DTW2 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sfmbt2Q5DTW2 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sfmbt2Q5DTW2 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sfmbt2Q5DTW2 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sfmbt2Q5DTW2 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sfmbt2Q5DTW2 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sfmbt2Q5DTW2 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sfmbt2Q5DTW2 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sfmbt2Q5DTW2 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sfmbt2Q5DTW2 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sfmbt2Q5DTW2 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sfmbt2Q5DTW2 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sfmbt2Q5DTW2 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sfmbt2Q5DTW2 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sfmbt2Q5DTW2 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sfmbt2Q5DTW2 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sfmbt2Q5DTW2 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sfmbt2Q5DTW2 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sfmbt2Q5DTW2 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sfmbt2Q5DTW2 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sfmbt2Q5DTW2 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sfmbt2Q5DTW2 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sfmbt2Q5DTW2 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sfmbt2Q5DTW2 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sfmbt2Q5DTW2 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sfmbt2Q5DTW2 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sfmbt2Q5DTW2 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sfmbt2Q5DTW2 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sfmbt2Q5DTW2 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sfmbt2Q5DTW2 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sfmbt2Q5DTW2 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sfmbt2Q5DTW2 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sfmbt2Q5DTW2 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sfmbt2Q5DTW2 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sfmbt2Q5DTW2 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sfmbt2Q5DTW2 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sfmbt2Q5DTW2 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sfmbt2Q5DTW2 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sfmbt2Q5DTW2 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sfmbt2Q5DTW2 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sfmbt2Q5DTW2 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sfmbt2Q5DTW2 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sfmbt2Q5DTW2 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sfmbt2Q5DTW2 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sfmbt2Q5DTW2 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sfmbt2Q5DTW2 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sfmbt2Q5DTW2 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sfmbt2Q5DTW2 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sfmbt2Q5DTW2 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sfmbt2Q5DTW2 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sfmbt2Q5DTW2 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sfmbt2Q5DTW2 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sfmbt2Q5DTW2 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sfmbt2Q5DTW2 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sfmbt2Q5DTW2 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.9 ms