Protein–RNA interactions for Protein: Q52KF3

Spire1, Protein spire homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire1Q52KF3 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spire1Q52KF3 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spire1Q52KF3 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Spire1Q52KF3 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spire1Q52KF3 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spire1Q52KF3 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spire1Q52KF3 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spire1Q52KF3 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Spire1Q52KF3 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Spire1Q52KF3 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Spire1Q52KF3 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Spire1Q52KF3 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Spire1Q52KF3 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Spire1Q52KF3 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Spire1Q52KF3 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spire1Q52KF3 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spire1Q52KF3 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spire1Q52KF3 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spire1Q52KF3 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spire1Q52KF3 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spire1Q52KF3 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spire1Q52KF3 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spire1Q52KF3 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spire1Q52KF3 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spire1Q52KF3 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spire1Q52KF3 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spire1Q52KF3 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spire1Q52KF3 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spire1Q52KF3 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spire1Q52KF3 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spire1Q52KF3 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spire1Q52KF3 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spire1Q52KF3 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Spire1Q52KF3 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Spire1Q52KF3 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spire1Q52KF3 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spire1Q52KF3 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spire1Q52KF3 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spire1Q52KF3 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Spire1Q52KF3 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Spire1Q52KF3 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spire1Q52KF3 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spire1Q52KF3 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Spire1Q52KF3 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Spire1Q52KF3 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Spire1Q52KF3 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Spire1Q52KF3 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Spire1Q52KF3 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Spire1Q52KF3 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Spire1Q52KF3 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Spire1Q52KF3 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Spire1Q52KF3 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spire1Q52KF3 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Spire1Q52KF3 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spire1Q52KF3 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spire1Q52KF3 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spire1Q52KF3 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spire1Q52KF3 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spire1Q52KF3 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spire1Q52KF3 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spire1Q52KF3 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spire1Q52KF3 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spire1Q52KF3 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spire1Q52KF3 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spire1Q52KF3 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spire1Q52KF3 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spire1Q52KF3 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spire1Q52KF3 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spire1Q52KF3 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spire1Q52KF3 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Spire1Q52KF3 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spire1Q52KF3 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spire1Q52KF3 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spire1Q52KF3 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spire1Q52KF3 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spire1Q52KF3 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spire1Q52KF3 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spire1Q52KF3 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spire1Q52KF3 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spire1Q52KF3 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spire1Q52KF3 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spire1Q52KF3 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spire1Q52KF3 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spire1Q52KF3 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spire1Q52KF3 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spire1Q52KF3 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spire1Q52KF3 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spire1Q52KF3 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spire1Q52KF3 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spire1Q52KF3 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spire1Q52KF3 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spire1Q52KF3 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spire1Q52KF3 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spire1Q52KF3 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spire1Q52KF3 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spire1Q52KF3 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spire1Q52KF3 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spire1Q52KF3 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spire1Q52KF3 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spire1Q52KF3 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms