Protein–RNA interactions for Protein: Q4PJX1

Odr4, Protein odr-4 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odr4Q4PJX1 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Odr4Q4PJX1 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Odr4Q4PJX1 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Odr4Q4PJX1 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Odr4Q4PJX1 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Odr4Q4PJX1 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Odr4Q4PJX1 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Odr4Q4PJX1 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Odr4Q4PJX1 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Odr4Q4PJX1 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Odr4Q4PJX1 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Odr4Q4PJX1 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Odr4Q4PJX1 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Odr4Q4PJX1 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Odr4Q4PJX1 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Odr4Q4PJX1 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Odr4Q4PJX1 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Odr4Q4PJX1 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Odr4Q4PJX1 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Odr4Q4PJX1 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Odr4Q4PJX1 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Odr4Q4PJX1 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Odr4Q4PJX1 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Odr4Q4PJX1 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Odr4Q4PJX1 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Odr4Q4PJX1 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Odr4Q4PJX1 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Odr4Q4PJX1 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Odr4Q4PJX1 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Odr4Q4PJX1 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Odr4Q4PJX1 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Odr4Q4PJX1 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Odr4Q4PJX1 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Odr4Q4PJX1 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Odr4Q4PJX1 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Odr4Q4PJX1 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Odr4Q4PJX1 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Odr4Q4PJX1 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Odr4Q4PJX1 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Odr4Q4PJX1 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Odr4Q4PJX1 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Odr4Q4PJX1 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Odr4Q4PJX1 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Odr4Q4PJX1 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Odr4Q4PJX1 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Odr4Q4PJX1 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Odr4Q4PJX1 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Odr4Q4PJX1 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Odr4Q4PJX1 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Odr4Q4PJX1 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Odr4Q4PJX1 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Odr4Q4PJX1 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Odr4Q4PJX1 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Odr4Q4PJX1 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Odr4Q4PJX1 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Odr4Q4PJX1 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Odr4Q4PJX1 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Odr4Q4PJX1 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Odr4Q4PJX1 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Odr4Q4PJX1 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Odr4Q4PJX1 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Odr4Q4PJX1 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Odr4Q4PJX1 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Odr4Q4PJX1 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Odr4Q4PJX1 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Odr4Q4PJX1 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Odr4Q4PJX1 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Odr4Q4PJX1 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Odr4Q4PJX1 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Odr4Q4PJX1 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Odr4Q4PJX1 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Odr4Q4PJX1 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Odr4Q4PJX1 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Odr4Q4PJX1 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Odr4Q4PJX1 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Odr4Q4PJX1 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Odr4Q4PJX1 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Odr4Q4PJX1 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Odr4Q4PJX1 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Odr4Q4PJX1 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Odr4Q4PJX1 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Odr4Q4PJX1 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Odr4Q4PJX1 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Odr4Q4PJX1 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Odr4Q4PJX1 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Odr4Q4PJX1 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Odr4Q4PJX1 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Odr4Q4PJX1 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Odr4Q4PJX1 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Odr4Q4PJX1 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Odr4Q4PJX1 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Odr4Q4PJX1 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Odr4Q4PJX1 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Odr4Q4PJX1 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Odr4Q4PJX1 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Odr4Q4PJX1 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Odr4Q4PJX1 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Odr4Q4PJX1 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Odr4Q4PJX1 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Odr4Q4PJX1 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms