Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL04

Gm5168, Predicted gene 5168, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5168Q4KL04 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5168Q4KL04 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5168Q4KL04 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5168Q4KL04 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5168Q4KL04 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5168Q4KL04 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5168Q4KL04 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5168Q4KL04 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5168Q4KL04 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5168Q4KL04 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5168Q4KL04 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5168Q4KL04 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5168Q4KL04 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5168Q4KL04 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5168Q4KL04 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5168Q4KL04 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5168Q4KL04 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5168Q4KL04 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5168Q4KL04 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5168Q4KL04 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5168Q4KL04 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5168Q4KL04 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5168Q4KL04 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5168Q4KL04 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5168Q4KL04 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5168Q4KL04 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5168Q4KL04 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5168Q4KL04 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5168Q4KL04 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5168Q4KL04 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5168Q4KL04 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5168Q4KL04 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5168Q4KL04 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5168Q4KL04 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5168Q4KL04 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5168Q4KL04 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5168Q4KL04 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5168Q4KL04 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5168Q4KL04 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5168Q4KL04 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5168Q4KL04 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5168Q4KL04 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5168Q4KL04 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5168Q4KL04 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5168Q4KL04 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5168Q4KL04 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5168Q4KL04 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm5168Q4KL04 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm5168Q4KL04 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm5168Q4KL04 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm5168Q4KL04 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm5168Q4KL04 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm5168Q4KL04 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm5168Q4KL04 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm5168Q4KL04 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm5168Q4KL04 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm5168Q4KL04 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm5168Q4KL04 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm5168Q4KL04 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm5168Q4KL04 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm5168Q4KL04 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm5168Q4KL04 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm5168Q4KL04 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm5168Q4KL04 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm5168Q4KL04 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Gm5168Q4KL04 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Gm5168Q4KL04 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Gm5168Q4KL04 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm5168Q4KL04 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm5168Q4KL04 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm5168Q4KL04 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm5168Q4KL04 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm5168Q4KL04 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm5168Q4KL04 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm5168Q4KL04 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm5168Q4KL04 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm5168Q4KL04 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm5168Q4KL04 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm5168Q4KL04 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm5168Q4KL04 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm5168Q4KL04 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm5168Q4KL04 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm5168Q4KL04 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm5168Q4KL04 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm5168Q4KL04 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm5168Q4KL04 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm5168Q4KL04 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm5168Q4KL04 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm5168Q4KL04 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm5168Q4KL04 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm5168Q4KL04 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm5168Q4KL04 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm5168Q4KL04 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm5168Q4KL04 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm5168Q4KL04 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm5168Q4KL04 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm5168Q4KL04 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm5168Q4KL04 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm5168Q4KL04 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm5168Q4KL04 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms