Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZN08

Fam220a, Protein FAM220A, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam220aQ3ZN08 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Fam220aQ3ZN08 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Fam220aQ3ZN08 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Fam220aQ3ZN08 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Fam220aQ3ZN08 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Fam220aQ3ZN08 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Fam220aQ3ZN08 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Fam220aQ3ZN08 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Fam220aQ3ZN08 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Fam220aQ3ZN08 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Fam220aQ3ZN08 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Fam220aQ3ZN08 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Fam220aQ3ZN08 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Fam220aQ3ZN08 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Fam220aQ3ZN08 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Fam220aQ3ZN08 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Fam220aQ3ZN08 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Fam220aQ3ZN08 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Fam220aQ3ZN08 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Fam220aQ3ZN08 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Fam220aQ3ZN08 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Fam220aQ3ZN08 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Fam220aQ3ZN08 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Fam220aQ3ZN08 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Fam220aQ3ZN08 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Fam220aQ3ZN08 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Fam220aQ3ZN08 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Fam220aQ3ZN08 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Fam220aQ3ZN08 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Fam220aQ3ZN08 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Fam220aQ3ZN08 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Fam220aQ3ZN08 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Fam220aQ3ZN08 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Fam220aQ3ZN08 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Fam220aQ3ZN08 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Fam220aQ3ZN08 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Fam220aQ3ZN08 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Fam220aQ3ZN08 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Fam220aQ3ZN08 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Fam220aQ3ZN08 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fam220aQ3ZN08 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fam220aQ3ZN08 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fam220aQ3ZN08 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fam220aQ3ZN08 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fam220aQ3ZN08 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fam220aQ3ZN08 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fam220aQ3ZN08 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fam220aQ3ZN08 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fam220aQ3ZN08 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fam220aQ3ZN08 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fam220aQ3ZN08 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fam220aQ3ZN08 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fam220aQ3ZN08 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fam220aQ3ZN08 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fam220aQ3ZN08 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fam220aQ3ZN08 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fam220aQ3ZN08 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fam220aQ3ZN08 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fam220aQ3ZN08 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fam220aQ3ZN08 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fam220aQ3ZN08 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Fam220aQ3ZN08 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fam220aQ3ZN08 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fam220aQ3ZN08 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fam220aQ3ZN08 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fam220aQ3ZN08 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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