Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3V9

Carmil2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil2Q3V3V9 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Carmil2Q3V3V9 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Carmil2Q3V3V9 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Carmil2Q3V3V9 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Carmil2Q3V3V9 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Carmil2Q3V3V9 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Carmil2Q3V3V9 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Carmil2Q3V3V9 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Carmil2Q3V3V9 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Carmil2Q3V3V9 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Carmil2Q3V3V9 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Carmil2Q3V3V9 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Carmil2Q3V3V9 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Carmil2Q3V3V9 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Carmil2Q3V3V9 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Carmil2Q3V3V9 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Carmil2Q3V3V9 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Carmil2Q3V3V9 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Carmil2Q3V3V9 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Carmil2Q3V3V9 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Carmil2Q3V3V9 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Carmil2Q3V3V9 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Carmil2Q3V3V9 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Carmil2Q3V3V9 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Carmil2Q3V3V9 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Carmil2Q3V3V9 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Carmil2Q3V3V9 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Carmil2Q3V3V9 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Carmil2Q3V3V9 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Carmil2Q3V3V9 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Carmil2Q3V3V9 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Carmil2Q3V3V9 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Carmil2Q3V3V9 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Carmil2Q3V3V9 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Carmil2Q3V3V9 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Carmil2Q3V3V9 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Carmil2Q3V3V9 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Carmil2Q3V3V9 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Carmil2Q3V3V9 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Carmil2Q3V3V9 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Carmil2Q3V3V9 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Carmil2Q3V3V9 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Carmil2Q3V3V9 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Carmil2Q3V3V9 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Carmil2Q3V3V9 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Carmil2Q3V3V9 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Carmil2Q3V3V9 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Carmil2Q3V3V9 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Carmil2Q3V3V9 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Carmil2Q3V3V9 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Carmil2Q3V3V9 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Carmil2Q3V3V9 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Carmil2Q3V3V9 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Carmil2Q3V3V9 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Carmil2Q3V3V9 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Carmil2Q3V3V9 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Carmil2Q3V3V9 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Carmil2Q3V3V9 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Carmil2Q3V3V9 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Carmil2Q3V3V9 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Carmil2Q3V3V9 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Carmil2Q3V3V9 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Carmil2Q3V3V9 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Carmil2Q3V3V9 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Carmil2Q3V3V9 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Carmil2Q3V3V9 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Carmil2Q3V3V9 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Carmil2Q3V3V9 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Carmil2Q3V3V9 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Carmil2Q3V3V9 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Carmil2Q3V3V9 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Carmil2Q3V3V9 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Carmil2Q3V3V9 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Carmil2Q3V3V9 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Carmil2Q3V3V9 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Carmil2Q3V3V9 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Carmil2Q3V3V9 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Carmil2Q3V3V9 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Carmil2Q3V3V9 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Carmil2Q3V3V9 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Carmil2Q3V3V9 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Carmil2Q3V3V9 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Carmil2Q3V3V9 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Carmil2Q3V3V9 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Carmil2Q3V3V9 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Carmil2Q3V3V9 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Carmil2Q3V3V9 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Carmil2Q3V3V9 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Carmil2Q3V3V9 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Carmil2Q3V3V9 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Carmil2Q3V3V9 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Carmil2Q3V3V9 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Carmil2Q3V3V9 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Carmil2Q3V3V9 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Carmil2Q3V3V9 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Carmil2Q3V3V9 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Carmil2Q3V3V9 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Carmil2Q3V3V9 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Carmil2Q3V3V9 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Carmil2Q3V3V9 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms