Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1H1

Ckap2, Cytoskeleton-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2Q3V1H1 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ckap2Q3V1H1 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ckap2Q3V1H1 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ckap2Q3V1H1 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ckap2Q3V1H1 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ckap2Q3V1H1 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ckap2Q3V1H1 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ckap2Q3V1H1 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ckap2Q3V1H1 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ckap2Q3V1H1 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ckap2Q3V1H1 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ckap2Q3V1H1 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ckap2Q3V1H1 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ckap2Q3V1H1 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ckap2Q3V1H1 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ckap2Q3V1H1 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ckap2Q3V1H1 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ckap2Q3V1H1 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ckap2Q3V1H1 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ckap2Q3V1H1 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ckap2Q3V1H1 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ckap2Q3V1H1 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ckap2Q3V1H1 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ckap2Q3V1H1 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ckap2Q3V1H1 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ckap2Q3V1H1 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ckap2Q3V1H1 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ckap2Q3V1H1 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ckap2Q3V1H1 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ckap2Q3V1H1 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ckap2Q3V1H1 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ckap2Q3V1H1 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ckap2Q3V1H1 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ckap2Q3V1H1 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ckap2Q3V1H1 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ckap2Q3V1H1 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ckap2Q3V1H1 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ckap2Q3V1H1 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ckap2Q3V1H1 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ckap2Q3V1H1 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ckap2Q3V1H1 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ckap2Q3V1H1 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ckap2Q3V1H1 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ckap2Q3V1H1 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ckap2Q3V1H1 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ckap2Q3V1H1 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ckap2Q3V1H1 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ckap2Q3V1H1 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ckap2Q3V1H1 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ckap2Q3V1H1 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ckap2Q3V1H1 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ckap2Q3V1H1 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ckap2Q3V1H1 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ckap2Q3V1H1 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ckap2Q3V1H1 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ckap2Q3V1H1 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ckap2Q3V1H1 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ckap2Q3V1H1 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ckap2Q3V1H1 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ckap2Q3V1H1 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ckap2Q3V1H1 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ckap2Q3V1H1 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ckap2Q3V1H1 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ckap2Q3V1H1 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ckap2Q3V1H1 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ckap2Q3V1H1 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ckap2Q3V1H1 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ckap2Q3V1H1 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ckap2Q3V1H1 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ckap2Q3V1H1 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ckap2Q3V1H1 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ckap2Q3V1H1 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ckap2Q3V1H1 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ckap2Q3V1H1 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ckap2Q3V1H1 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ckap2Q3V1H1 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ckap2Q3V1H1 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ckap2Q3V1H1 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ckap2Q3V1H1 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ckap2Q3V1H1 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ckap2Q3V1H1 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ckap2Q3V1H1 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ckap2Q3V1H1 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ckap2Q3V1H1 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ckap2Q3V1H1 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ckap2Q3V1H1 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ckap2Q3V1H1 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ckap2Q3V1H1 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ckap2Q3V1H1 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ckap2Q3V1H1 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ckap2Q3V1H1 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ckap2Q3V1H1 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ckap2Q3V1H1 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ckap2Q3V1H1 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ckap2Q3V1H1 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ckap2Q3V1H1 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ckap2Q3V1H1 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ckap2Q3V1H1 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ckap2Q3V1H1 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ckap2Q3V1H1 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms