Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYG1

Ccdc160, Coiled-coil domain-containing protein 160, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc160Q3UYG1 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc160Q3UYG1 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc160Q3UYG1 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc160Q3UYG1 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc160Q3UYG1 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc160Q3UYG1 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc160Q3UYG1 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc160Q3UYG1 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc160Q3UYG1 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc160Q3UYG1 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc160Q3UYG1 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc160Q3UYG1 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc160Q3UYG1 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc160Q3UYG1 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc160Q3UYG1 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc160Q3UYG1 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc160Q3UYG1 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc160Q3UYG1 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc160Q3UYG1 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc160Q3UYG1 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc160Q3UYG1 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc160Q3UYG1 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc160Q3UYG1 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc160Q3UYG1 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc160Q3UYG1 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc160Q3UYG1 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc160Q3UYG1 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc160Q3UYG1 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc160Q3UYG1 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc160Q3UYG1 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc160Q3UYG1 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc160Q3UYG1 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc160Q3UYG1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc160Q3UYG1 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc160Q3UYG1 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc160Q3UYG1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc160Q3UYG1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc160Q3UYG1 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc160Q3UYG1 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc160Q3UYG1 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc160Q3UYG1 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc160Q3UYG1 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc160Q3UYG1 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc160Q3UYG1 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc160Q3UYG1 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc160Q3UYG1 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc160Q3UYG1 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc160Q3UYG1 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc160Q3UYG1 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc160Q3UYG1 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc160Q3UYG1 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc160Q3UYG1 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc160Q3UYG1 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc160Q3UYG1 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc160Q3UYG1 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc160Q3UYG1 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc160Q3UYG1 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc160Q3UYG1 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc160Q3UYG1 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc160Q3UYG1 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc160Q3UYG1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc160Q3UYG1 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc160Q3UYG1 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc160Q3UYG1 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc160Q3UYG1 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc160Q3UYG1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc160Q3UYG1 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc160Q3UYG1 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc160Q3UYG1 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc160Q3UYG1 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc160Q3UYG1 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc160Q3UYG1 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc160Q3UYG1 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc160Q3UYG1 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc160Q3UYG1 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc160Q3UYG1 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc160Q3UYG1 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc160Q3UYG1 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc160Q3UYG1 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc160Q3UYG1 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc160Q3UYG1 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc160Q3UYG1 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc160Q3UYG1 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc160Q3UYG1 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc160Q3UYG1 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc160Q3UYG1 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc160Q3UYG1 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc160Q3UYG1 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc160Q3UYG1 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc160Q3UYG1 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc160Q3UYG1 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc160Q3UYG1 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc160Q3UYG1 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc160Q3UYG1 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc160Q3UYG1 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc160Q3UYG1 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc160Q3UYG1 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc160Q3UYG1 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc160Q3UYG1 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc160Q3UYG1 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms