Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW98

Clca4b, Chloride channel accessory 4B, mousemouse

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca4bQ3UW98 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clca4bQ3UW98 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clca4bQ3UW98 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clca4bQ3UW98 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clca4bQ3UW98 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clca4bQ3UW98 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clca4bQ3UW98 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clca4bQ3UW98 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clca4bQ3UW98 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clca4bQ3UW98 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clca4bQ3UW98 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clca4bQ3UW98 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clca4bQ3UW98 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clca4bQ3UW98 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clca4bQ3UW98 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clca4bQ3UW98 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Clca4bQ3UW98 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Clca4bQ3UW98 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Clca4bQ3UW98 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Clca4bQ3UW98 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Clca4bQ3UW98 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Clca4bQ3UW98 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Clca4bQ3UW98 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Clca4bQ3UW98 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clca4bQ3UW98 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clca4bQ3UW98 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clca4bQ3UW98 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clca4bQ3UW98 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clca4bQ3UW98 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clca4bQ3UW98 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clca4bQ3UW98 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clca4bQ3UW98 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clca4bQ3UW98 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clca4bQ3UW98 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clca4bQ3UW98 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clca4bQ3UW98 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clca4bQ3UW98 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clca4bQ3UW98 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clca4bQ3UW98 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clca4bQ3UW98 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clca4bQ3UW98 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clca4bQ3UW98 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clca4bQ3UW98 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clca4bQ3UW98 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clca4bQ3UW98 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clca4bQ3UW98 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clca4bQ3UW98 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clca4bQ3UW98 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clca4bQ3UW98 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clca4bQ3UW98 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Clca4bQ3UW98 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Clca4bQ3UW98 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clca4bQ3UW98 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clca4bQ3UW98 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clca4bQ3UW98 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clca4bQ3UW98 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clca4bQ3UW98 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clca4bQ3UW98 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clca4bQ3UW98 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clca4bQ3UW98 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clca4bQ3UW98 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clca4bQ3UW98 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clca4bQ3UW98 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clca4bQ3UW98 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clca4bQ3UW98 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clca4bQ3UW98 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clca4bQ3UW98 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clca4bQ3UW98 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clca4bQ3UW98 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clca4bQ3UW98 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Clca4bQ3UW98 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clca4bQ3UW98 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Clca4bQ3UW98 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clca4bQ3UW98 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clca4bQ3UW98 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Clca4bQ3UW98 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clca4bQ3UW98 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clca4bQ3UW98 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clca4bQ3UW98 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clca4bQ3UW98 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clca4bQ3UW98 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clca4bQ3UW98 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clca4bQ3UW98 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clca4bQ3UW98 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clca4bQ3UW98 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clca4bQ3UW98 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clca4bQ3UW98 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clca4bQ3UW98 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Clca4bQ3UW98 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clca4bQ3UW98 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clca4bQ3UW98 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clca4bQ3UW98 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clca4bQ3UW98 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clca4bQ3UW98 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clca4bQ3UW98 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clca4bQ3UW98 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clca4bQ3UW98 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clca4bQ3UW98 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clca4bQ3UW98 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clca4bQ3UW98 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms