Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP24

Nlrc4, NLR family CARD domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc4Q3UP24 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nlrc4Q3UP24 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nlrc4Q3UP24 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nlrc4Q3UP24 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nlrc4Q3UP24 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nlrc4Q3UP24 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Nlrc4Q3UP24 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nlrc4Q3UP24 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nlrc4Q3UP24 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nlrc4Q3UP24 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nlrc4Q3UP24 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nlrc4Q3UP24 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Nlrc4Q3UP24 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nlrc4Q3UP24 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nlrc4Q3UP24 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nlrc4Q3UP24 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nlrc4Q3UP24 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nlrc4Q3UP24 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nlrc4Q3UP24 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nlrc4Q3UP24 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlrc4Q3UP24 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlrc4Q3UP24 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlrc4Q3UP24 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlrc4Q3UP24 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlrc4Q3UP24 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlrc4Q3UP24 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlrc4Q3UP24 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlrc4Q3UP24 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlrc4Q3UP24 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlrc4Q3UP24 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlrc4Q3UP24 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlrc4Q3UP24 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlrc4Q3UP24 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlrc4Q3UP24 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlrc4Q3UP24 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlrc4Q3UP24 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlrc4Q3UP24 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlrc4Q3UP24 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlrc4Q3UP24 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlrc4Q3UP24 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlrc4Q3UP24 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlrc4Q3UP24 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlrc4Q3UP24 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlrc4Q3UP24 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlrc4Q3UP24 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlrc4Q3UP24 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlrc4Q3UP24 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlrc4Q3UP24 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlrc4Q3UP24 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlrc4Q3UP24 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlrc4Q3UP24 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlrc4Q3UP24 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlrc4Q3UP24 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlrc4Q3UP24 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlrc4Q3UP24 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlrc4Q3UP24 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlrc4Q3UP24 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlrc4Q3UP24 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlrc4Q3UP24 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlrc4Q3UP24 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlrc4Q3UP24 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlrc4Q3UP24 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlrc4Q3UP24 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlrc4Q3UP24 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlrc4Q3UP24 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlrc4Q3UP24 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlrc4Q3UP24 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlrc4Q3UP24 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlrc4Q3UP24 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlrc4Q3UP24 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlrc4Q3UP24 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlrc4Q3UP24 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlrc4Q3UP24 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlrc4Q3UP24 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlrc4Q3UP24 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlrc4Q3UP24 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlrc4Q3UP24 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlrc4Q3UP24 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlrc4Q3UP24 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlrc4Q3UP24 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlrc4Q3UP24 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Nlrc4Q3UP24 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nlrc4Q3UP24 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nlrc4Q3UP24 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nlrc4Q3UP24 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nlrc4Q3UP24 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nlrc4Q3UP24 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nlrc4Q3UP24 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nlrc4Q3UP24 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nlrc4Q3UP24 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nlrc4Q3UP24 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nlrc4Q3UP24 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nlrc4Q3UP24 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nlrc4Q3UP24 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nlrc4Q3UP24 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nlrc4Q3UP24 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nlrc4Q3UP24 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nlrc4Q3UP24 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nlrc4Q3UP24 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nlrc4Q3UP24 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms