Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMU9

Hdgfl2, Hepatoma-derived growth factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl2Q3UMU9 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hdgfl2Q3UMU9 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hdgfl2Q3UMU9 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdgfl2Q3UMU9 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdgfl2Q3UMU9 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdgfl2Q3UMU9 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdgfl2Q3UMU9 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdgfl2Q3UMU9 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdgfl2Q3UMU9 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdgfl2Q3UMU9 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdgfl2Q3UMU9 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdgfl2Q3UMU9 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms