Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMG5

Lrch2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrch2Q3UMG5 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrch2Q3UMG5 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrch2Q3UMG5 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrch2Q3UMG5 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrch2Q3UMG5 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrch2Q3UMG5 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrch2Q3UMG5 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrch2Q3UMG5 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrch2Q3UMG5 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrch2Q3UMG5 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrch2Q3UMG5 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrch2Q3UMG5 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrch2Q3UMG5 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrch2Q3UMG5 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrch2Q3UMG5 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrch2Q3UMG5 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrch2Q3UMG5 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrch2Q3UMG5 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrch2Q3UMG5 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrch2Q3UMG5 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrch2Q3UMG5 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrch2Q3UMG5 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrch2Q3UMG5 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrch2Q3UMG5 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrch2Q3UMG5 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrch2Q3UMG5 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrch2Q3UMG5 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrch2Q3UMG5 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrch2Q3UMG5 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrch2Q3UMG5 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrch2Q3UMG5 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrch2Q3UMG5 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrch2Q3UMG5 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrch2Q3UMG5 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrch2Q3UMG5 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrch2Q3UMG5 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrch2Q3UMG5 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrch2Q3UMG5 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrch2Q3UMG5 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrch2Q3UMG5 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrch2Q3UMG5 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrch2Q3UMG5 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrch2Q3UMG5 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrch2Q3UMG5 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrch2Q3UMG5 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrch2Q3UMG5 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrch2Q3UMG5 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrch2Q3UMG5 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrch2Q3UMG5 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrch2Q3UMG5 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrch2Q3UMG5 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrch2Q3UMG5 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrch2Q3UMG5 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrch2Q3UMG5 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrch2Q3UMG5 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrch2Q3UMG5 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrch2Q3UMG5 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrch2Q3UMG5 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrch2Q3UMG5 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrch2Q3UMG5 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrch2Q3UMG5 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrch2Q3UMG5 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrch2Q3UMG5 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrch2Q3UMG5 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrch2Q3UMG5 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrch2Q3UMG5 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrch2Q3UMG5 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrch2Q3UMG5 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrch2Q3UMG5 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrch2Q3UMG5 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrch2Q3UMG5 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrch2Q3UMG5 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrch2Q3UMG5 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrch2Q3UMG5 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrch2Q3UMG5 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrch2Q3UMG5 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrch2Q3UMG5 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrch2Q3UMG5 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrch2Q3UMG5 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrch2Q3UMG5 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrch2Q3UMG5 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrch2Q3UMG5 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrch2Q3UMG5 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrch2Q3UMG5 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrch2Q3UMG5 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrch2Q3UMG5 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrch2Q3UMG5 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrch2Q3UMG5 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrch2Q3UMG5 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrch2Q3UMG5 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrch2Q3UMG5 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrch2Q3UMG5 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrch2Q3UMG5 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrch2Q3UMG5 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrch2Q3UMG5 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrch2Q3UMG5 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrch2Q3UMG5 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrch2Q3UMG5 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrch2Q3UMG5 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrch2Q3UMG5 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms