Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJF0

Gpr55, G-protein coupled receptor 55, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpr55Q3UJF0 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gpr55Q3UJF0 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Gpr55Q3UJF0 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gpr55Q3UJF0 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Gpr55Q3UJF0 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gpr55Q3UJF0 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gpr55Q3UJF0 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gpr55Q3UJF0 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gpr55Q3UJF0 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Gpr55Q3UJF0 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gpr55Q3UJF0 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Gpr55Q3UJF0 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gpr55Q3UJF0 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Gpr55Q3UJF0 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gpr55Q3UJF0 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gpr55Q3UJF0 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gpr55Q3UJF0 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gpr55Q3UJF0 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gpr55Q3UJF0 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gpr55Q3UJF0 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Gpr55Q3UJF0 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Gpr55Q3UJF0 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Gpr55Q3UJF0 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gpr55Q3UJF0 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gpr55Q3UJF0 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gpr55Q3UJF0 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gpr55Q3UJF0 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gpr55Q3UJF0 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Gpr55Q3UJF0 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gpr55Q3UJF0 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gpr55Q3UJF0 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gpr55Q3UJF0 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gpr55Q3UJF0 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gpr55Q3UJF0 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gpr55Q3UJF0 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gpr55Q3UJF0 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gpr55Q3UJF0 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gpr55Q3UJF0 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gpr55Q3UJF0 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gpr55Q3UJF0 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gpr55Q3UJF0 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gpr55Q3UJF0 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gpr55Q3UJF0 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gpr55Q3UJF0 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gpr55Q3UJF0 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gpr55Q3UJF0 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gpr55Q3UJF0 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gpr55Q3UJF0 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gpr55Q3UJF0 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gpr55Q3UJF0 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gpr55Q3UJF0 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gpr55Q3UJF0 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gpr55Q3UJF0 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gpr55Q3UJF0 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gpr55Q3UJF0 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gpr55Q3UJF0 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gpr55Q3UJF0 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gpr55Q3UJF0 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Gpr55Q3UJF0 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gpr55Q3UJF0 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gpr55Q3UJF0 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gpr55Q3UJF0 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gpr55Q3UJF0 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gpr55Q3UJF0 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gpr55Q3UJF0 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gpr55Q3UJF0 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gpr55Q3UJF0 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gpr55Q3UJF0 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gpr55Q3UJF0 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gpr55Q3UJF0 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Gpr55Q3UJF0 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gpr55Q3UJF0 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gpr55Q3UJF0 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gpr55Q3UJF0 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gpr55Q3UJF0 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gpr55Q3UJF0 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gpr55Q3UJF0 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gpr55Q3UJF0 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Gpr55Q3UJF0 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gpr55Q3UJF0 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gpr55Q3UJF0 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gpr55Q3UJF0 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gpr55Q3UJF0 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gpr55Q3UJF0 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gpr55Q3UJF0 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gpr55Q3UJF0 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gpr55Q3UJF0 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gpr55Q3UJF0 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gpr55Q3UJF0 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gpr55Q3UJF0 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gpr55Q3UJF0 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gpr55Q3UJF0 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gpr55Q3UJF0 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gpr55Q3UJF0 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gpr55Q3UJF0 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gpr55Q3UJF0 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gpr55Q3UJF0 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gpr55Q3UJF0 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gpr55Q3UJF0 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gpr55Q3UJF0 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms