Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp19Q3UJD6 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp19Q3UJD6 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp19Q3UJD6 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp19Q3UJD6 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp19Q3UJD6 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp19Q3UJD6 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp19Q3UJD6 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp19Q3UJD6 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp19Q3UJD6 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp19Q3UJD6 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp19Q3UJD6 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp19Q3UJD6 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Usp19Q3UJD6 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Usp19Q3UJD6 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Usp19Q3UJD6 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Usp19Q3UJD6 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Usp19Q3UJD6 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Usp19Q3UJD6 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Usp19Q3UJD6 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp19Q3UJD6 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp19Q3UJD6 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp19Q3UJD6 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp19Q3UJD6 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp19Q3UJD6 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp19Q3UJD6 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp19Q3UJD6 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp19Q3UJD6 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp19Q3UJD6 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp19Q3UJD6 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp19Q3UJD6 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp19Q3UJD6 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp19Q3UJD6 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp19Q3UJD6 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp19Q3UJD6 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp19Q3UJD6 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp19Q3UJD6 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp19Q3UJD6 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp19Q3UJD6 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp19Q3UJD6 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp19Q3UJD6 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp19Q3UJD6 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp19Q3UJD6 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp19Q3UJD6 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp19Q3UJD6 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp19Q3UJD6 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp19Q3UJD6 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp19Q3UJD6 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp19Q3UJD6 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp19Q3UJD6 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp19Q3UJD6 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp19Q3UJD6 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp19Q3UJD6 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp19Q3UJD6 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp19Q3UJD6 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp19Q3UJD6 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp19Q3UJD6 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp19Q3UJD6 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp19Q3UJD6 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp19Q3UJD6 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp19Q3UJD6 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp19Q3UJD6 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp19Q3UJD6 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp19Q3UJD6 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp19Q3UJD6 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp19Q3UJD6 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp19Q3UJD6 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp19Q3UJD6 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp19Q3UJD6 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp19Q3UJD6 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp19Q3UJD6 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp19Q3UJD6 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp19Q3UJD6 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp19Q3UJD6 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp19Q3UJD6 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp19Q3UJD6 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp19Q3UJD6 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp19Q3UJD6 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp19Q3UJD6 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp19Q3UJD6 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp19Q3UJD6 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp19Q3UJD6 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp19Q3UJD6 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp19Q3UJD6 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp19Q3UJD6 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp19Q3UJD6 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp19Q3UJD6 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp19Q3UJD6 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp19Q3UJD6 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp19Q3UJD6 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp19Q3UJD6 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp19Q3UJD6 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp19Q3UJD6 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp19Q3UJD6 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp19Q3UJD6 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp19Q3UJD6 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp19Q3UJD6 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp19Q3UJD6 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp19Q3UJD6 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp19Q3UJD6 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms