Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc34Q3UI66 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc34Q3UI66 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc34Q3UI66 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc34Q3UI66 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc34Q3UI66 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc34Q3UI66 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc34Q3UI66 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc34Q3UI66 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc34Q3UI66 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc34Q3UI66 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc34Q3UI66 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc34Q3UI66 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc34Q3UI66 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc34Q3UI66 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc34Q3UI66 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc34Q3UI66 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc34Q3UI66 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc34Q3UI66 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc34Q3UI66 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc34Q3UI66 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc34Q3UI66 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc34Q3UI66 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc34Q3UI66 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc34Q3UI66 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc34Q3UI66 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc34Q3UI66 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc34Q3UI66 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc34Q3UI66 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc34Q3UI66 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc34Q3UI66 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc34Q3UI66 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc34Q3UI66 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc34Q3UI66 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc34Q3UI66 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc34Q3UI66 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc34Q3UI66 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc34Q3UI66 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc34Q3UI66 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc34Q3UI66 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc34Q3UI66 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc34Q3UI66 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc34Q3UI66 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc34Q3UI66 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc34Q3UI66 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc34Q3UI66 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc34Q3UI66 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc34Q3UI66 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc34Q3UI66 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc34Q3UI66 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc34Q3UI66 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc34Q3UI66 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc34Q3UI66 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc34Q3UI66 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc34Q3UI66 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc34Q3UI66 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc34Q3UI66 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc34Q3UI66 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc34Q3UI66 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc34Q3UI66 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc34Q3UI66 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc34Q3UI66 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc34Q3UI66 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc34Q3UI66 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc34Q3UI66 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc34Q3UI66 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc34Q3UI66 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc34Q3UI66 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc34Q3UI66 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc34Q3UI66 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc34Q3UI66 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc34Q3UI66 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc34Q3UI66 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc34Q3UI66 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc34Q3UI66 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc34Q3UI66 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc34Q3UI66 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc34Q3UI66 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc34Q3UI66 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc34Q3UI66 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc34Q3UI66 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc34Q3UI66 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc34Q3UI66 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc34Q3UI66 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc34Q3UI66 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc34Q3UI66 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc34Q3UI66 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc34Q3UI66 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc34Q3UI66 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc34Q3UI66 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc34Q3UI66 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc34Q3UI66 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc34Q3UI66 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc34Q3UI66 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc34Q3UI66 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc34Q3UI66 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc34Q3UI66 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc34Q3UI66 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ccdc34Q3UI66 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ccdc34Q3UI66 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms