Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHK3

Greb1, Protein GREB1, mousemouse

Predictions only

Length 1,954 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Greb1Q3UHK3 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Greb1Q3UHK3 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Greb1Q3UHK3 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Greb1Q3UHK3 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Greb1Q3UHK3 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Greb1Q3UHK3 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Greb1Q3UHK3 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Greb1Q3UHK3 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Greb1Q3UHK3 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Greb1Q3UHK3 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Greb1Q3UHK3 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Greb1Q3UHK3 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Greb1Q3UHK3 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Greb1Q3UHK3 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Greb1Q3UHK3 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Greb1Q3UHK3 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Greb1Q3UHK3 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Greb1Q3UHK3 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Greb1Q3UHK3 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Greb1Q3UHK3 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Greb1Q3UHK3 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Greb1Q3UHK3 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Greb1Q3UHK3 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Greb1Q3UHK3 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Greb1Q3UHK3 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Greb1Q3UHK3 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Greb1Q3UHK3 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Greb1Q3UHK3 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Greb1Q3UHK3 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Greb1Q3UHK3 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Greb1Q3UHK3 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Greb1Q3UHK3 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Greb1Q3UHK3 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Greb1Q3UHK3 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Greb1Q3UHK3 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Greb1Q3UHK3 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Greb1Q3UHK3 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Greb1Q3UHK3 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Greb1Q3UHK3 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Greb1Q3UHK3 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Greb1Q3UHK3 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Greb1Q3UHK3 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Greb1Q3UHK3 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Greb1Q3UHK3 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Greb1Q3UHK3 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Greb1Q3UHK3 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Greb1Q3UHK3 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Greb1Q3UHK3 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Greb1Q3UHK3 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Greb1Q3UHK3 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Greb1Q3UHK3 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Greb1Q3UHK3 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Greb1Q3UHK3 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Greb1Q3UHK3 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Greb1Q3UHK3 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Greb1Q3UHK3 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Greb1Q3UHK3 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Greb1Q3UHK3 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Greb1Q3UHK3 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Greb1Q3UHK3 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Greb1Q3UHK3 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Greb1Q3UHK3 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Greb1Q3UHK3 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Greb1Q3UHK3 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Greb1Q3UHK3 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Greb1Q3UHK3 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Greb1Q3UHK3 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Greb1Q3UHK3 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Greb1Q3UHK3 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Greb1Q3UHK3 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Greb1Q3UHK3 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Greb1Q3UHK3 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Greb1Q3UHK3 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Greb1Q3UHK3 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Greb1Q3UHK3 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Greb1Q3UHK3 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Greb1Q3UHK3 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Greb1Q3UHK3 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Greb1Q3UHK3 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Greb1Q3UHK3 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Greb1Q3UHK3 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Greb1Q3UHK3 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Greb1Q3UHK3 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Greb1Q3UHK3 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Greb1Q3UHK3 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Greb1Q3UHK3 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Greb1Q3UHK3 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Greb1Q3UHK3 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Greb1Q3UHK3 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Greb1Q3UHK3 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Greb1Q3UHK3 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Greb1Q3UHK3 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Greb1Q3UHK3 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Greb1Q3UHK3 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Greb1Q3UHK3 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Greb1Q3UHK3 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Greb1Q3UHK3 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Greb1Q3UHK3 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Greb1Q3UHK3 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Greb1Q3UHK3 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms