Protein–RNA interactions for Protein: Q3U898

Cops9, COP9 signalosome complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops9Q3U898 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cops9Q3U898 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms