Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q3U6N9 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q3U6N9 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q3U6N9 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q3U6N9 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q3U6N9 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q3U6N9 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q3U6N9 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q3U6N9 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q3U6N9 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Q3U6N9 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q3U6N9 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q3U6N9 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Q3U6N9 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q3U6N9 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q3U6N9 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q3U6N9 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q3U6N9 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q3U6N9 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q3U6N9 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q3U6N9 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q3U6N9 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q3U6N9 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q3U6N9 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Q3U6N9 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q3U6N9 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q3U6N9 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q3U6N9 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q3U6N9 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q3U6N9 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q3U6N9 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q3U6N9 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q3U6N9 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q3U6N9 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q3U6N9 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q3U6N9 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Q3U6N9 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q3U6N9 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Q3U6N9 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Q3U6N9 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q3U6N9 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q3U6N9 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q3U6N9 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q3U6N9 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q3U6N9 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q3U6N9 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q3U6N9 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q3U6N9 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q3U6N9 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q3U6N9 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q3U6N9 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q3U6N9 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q3U6N9 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q3U6N9 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q3U6N9 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q3U6N9 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q3U6N9 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q3U6N9 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q3U6N9 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q3U6N9 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q3U6N9 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q3U6N9 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q3U6N9 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q3U6N9 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q3U6N9 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Q3U6N9 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Q3U6N9 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q3U6N9 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q3U6N9 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Q3U6N9 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q3U6N9 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q3U6N9 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q3U6N9 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q3U6N9 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Q3U6N9 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q3U6N9 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q3U6N9 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q3U6N9 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q3U6N9 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q3U6N9 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q3U6N9 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q3U6N9 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q3U6N9 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q3U6N9 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q3U6N9 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q3U6N9 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3U6N9 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3U6N9 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3U6N9 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3U6N9 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3U6N9 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3U6N9 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3U6N9 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3U6N9 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3U6N9 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3U6N9 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3U6N9 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3U6N9 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3U6N9 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3U6N9 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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