Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S4

Otud5, OTU domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud5Q3U2S4 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Otud5Q3U2S4 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Otud5Q3U2S4 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Otud5Q3U2S4 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Otud5Q3U2S4 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Otud5Q3U2S4 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Otud5Q3U2S4 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Otud5Q3U2S4 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Otud5Q3U2S4 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Otud5Q3U2S4 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Otud5Q3U2S4 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Otud5Q3U2S4 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Otud5Q3U2S4 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Otud5Q3U2S4 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Otud5Q3U2S4 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Otud5Q3U2S4 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Otud5Q3U2S4 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Otud5Q3U2S4 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Otud5Q3U2S4 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Otud5Q3U2S4 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Otud5Q3U2S4 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Otud5Q3U2S4 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Otud5Q3U2S4 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Otud5Q3U2S4 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Otud5Q3U2S4 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Otud5Q3U2S4 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Otud5Q3U2S4 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Otud5Q3U2S4 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Otud5Q3U2S4 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Otud5Q3U2S4 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Otud5Q3U2S4 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Otud5Q3U2S4 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Otud5Q3U2S4 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Otud5Q3U2S4 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Otud5Q3U2S4 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Otud5Q3U2S4 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Otud5Q3U2S4 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Otud5Q3U2S4 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Otud5Q3U2S4 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Otud5Q3U2S4 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Otud5Q3U2S4 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Otud5Q3U2S4 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Otud5Q3U2S4 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Otud5Q3U2S4 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Otud5Q3U2S4 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Otud5Q3U2S4 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Otud5Q3U2S4 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Otud5Q3U2S4 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Otud5Q3U2S4 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Otud5Q3U2S4 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Otud5Q3U2S4 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Otud5Q3U2S4 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Otud5Q3U2S4 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Otud5Q3U2S4 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Otud5Q3U2S4 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Otud5Q3U2S4 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Otud5Q3U2S4 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Otud5Q3U2S4 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Otud5Q3U2S4 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Otud5Q3U2S4 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Otud5Q3U2S4 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Otud5Q3U2S4 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Otud5Q3U2S4 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Otud5Q3U2S4 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Otud5Q3U2S4 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Otud5Q3U2S4 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Otud5Q3U2S4 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Otud5Q3U2S4 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Otud5Q3U2S4 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Otud5Q3U2S4 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Otud5Q3U2S4 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Otud5Q3U2S4 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Otud5Q3U2S4 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Otud5Q3U2S4 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Otud5Q3U2S4 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Otud5Q3U2S4 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Otud5Q3U2S4 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Otud5Q3U2S4 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Otud5Q3U2S4 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Otud5Q3U2S4 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Otud5Q3U2S4 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Otud5Q3U2S4 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Otud5Q3U2S4 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Otud5Q3U2S4 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Otud5Q3U2S4 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Otud5Q3U2S4 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Otud5Q3U2S4 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Otud5Q3U2S4 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Otud5Q3U2S4 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Otud5Q3U2S4 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Otud5Q3U2S4 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Otud5Q3U2S4 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Otud5Q3U2S4 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Otud5Q3U2S4 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Otud5Q3U2S4 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Otud5Q3U2S4 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Otud5Q3U2S4 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Otud5Q3U2S4 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Otud5Q3U2S4 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Otud5Q3U2S4 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms