Protein–RNA interactions for Protein: Q3U155

Ccdc174, Coiled-coil domain-containing protein 174, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc174Q3U155 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc174Q3U155 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc174Q3U155 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc174Q3U155 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc174Q3U155 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc174Q3U155 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc174Q3U155 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc174Q3U155 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc174Q3U155 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc174Q3U155 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc174Q3U155 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc174Q3U155 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc174Q3U155 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc174Q3U155 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc174Q3U155 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc174Q3U155 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc174Q3U155 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc174Q3U155 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc174Q3U155 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc174Q3U155 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc174Q3U155 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc174Q3U155 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc174Q3U155 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc174Q3U155 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc174Q3U155 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc174Q3U155 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc174Q3U155 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc174Q3U155 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc174Q3U155 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc174Q3U155 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc174Q3U155 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc174Q3U155 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc174Q3U155 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc174Q3U155 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc174Q3U155 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc174Q3U155 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc174Q3U155 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc174Q3U155 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc174Q3U155 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc174Q3U155 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc174Q3U155 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc174Q3U155 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc174Q3U155 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc174Q3U155 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc174Q3U155 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc174Q3U155 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc174Q3U155 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc174Q3U155 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc174Q3U155 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc174Q3U155 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc174Q3U155 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc174Q3U155 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc174Q3U155 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc174Q3U155 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc174Q3U155 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc174Q3U155 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc174Q3U155 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc174Q3U155 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc174Q3U155 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc174Q3U155 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc174Q3U155 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc174Q3U155 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc174Q3U155 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc174Q3U155 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc174Q3U155 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc174Q3U155 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc174Q3U155 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc174Q3U155 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc174Q3U155 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc174Q3U155 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc174Q3U155 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc174Q3U155 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc174Q3U155 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc174Q3U155 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc174Q3U155 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc174Q3U155 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc174Q3U155 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc174Q3U155 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc174Q3U155 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc174Q3U155 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc174Q3U155 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc174Q3U155 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc174Q3U155 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc174Q3U155 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc174Q3U155 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc174Q3U155 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc174Q3U155 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc174Q3U155 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc174Q3U155 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc174Q3U155 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc174Q3U155 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc174Q3U155 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc174Q3U155 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc174Q3U155 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc174Q3U155 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc174Q3U155 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc174Q3U155 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc174Q3U155 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc174Q3U155 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc174Q3U155 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms