Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc9Q3U0M1 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trappc9Q3U0M1 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trappc9Q3U0M1 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trappc9Q3U0M1 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trappc9Q3U0M1 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trappc9Q3U0M1 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trappc9Q3U0M1 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trappc9Q3U0M1 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trappc9Q3U0M1 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trappc9Q3U0M1 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trappc9Q3U0M1 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trappc9Q3U0M1 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc9Q3U0M1 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc9Q3U0M1 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc9Q3U0M1 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc9Q3U0M1 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc9Q3U0M1 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc9Q3U0M1 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc9Q3U0M1 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc9Q3U0M1 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc9Q3U0M1 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc9Q3U0M1 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc9Q3U0M1 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc9Q3U0M1 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc9Q3U0M1 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc9Q3U0M1 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc9Q3U0M1 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc9Q3U0M1 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc9Q3U0M1 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc9Q3U0M1 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc9Q3U0M1 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc9Q3U0M1 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc9Q3U0M1 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc9Q3U0M1 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc9Q3U0M1 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc9Q3U0M1 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc9Q3U0M1 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc9Q3U0M1 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc9Q3U0M1 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc9Q3U0M1 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc9Q3U0M1 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc9Q3U0M1 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc9Q3U0M1 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc9Q3U0M1 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc9Q3U0M1 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc9Q3U0M1 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc9Q3U0M1 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc9Q3U0M1 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc9Q3U0M1 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc9Q3U0M1 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc9Q3U0M1 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc9Q3U0M1 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc9Q3U0M1 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc9Q3U0M1 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc9Q3U0M1 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc9Q3U0M1 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc9Q3U0M1 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc9Q3U0M1 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc9Q3U0M1 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc9Q3U0M1 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc9Q3U0M1 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc9Q3U0M1 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc9Q3U0M1 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc9Q3U0M1 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc9Q3U0M1 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc9Q3U0M1 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc9Q3U0M1 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc9Q3U0M1 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc9Q3U0M1 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc9Q3U0M1 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc9Q3U0M1 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc9Q3U0M1 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc9Q3U0M1 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc9Q3U0M1 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc9Q3U0M1 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc9Q3U0M1 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc9Q3U0M1 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc9Q3U0M1 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc9Q3U0M1 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc9Q3U0M1 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc9Q3U0M1 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc9Q3U0M1 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc9Q3U0M1 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc9Q3U0M1 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc9Q3U0M1 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc9Q3U0M1 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc9Q3U0M1 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc9Q3U0M1 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc9Q3U0M1 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc9Q3U0M1 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc9Q3U0M1 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc9Q3U0M1 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc9Q3U0M1 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc9Q3U0M1 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc9Q3U0M1 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc9Q3U0M1 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc9Q3U0M1 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc9Q3U0M1 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc9Q3U0M1 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms