Protein–RNA interactions for Protein: Q3TZA2

Cdkl4, Cyclin-dependent kinase-like 4, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl4Q3TZA2 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdkl4Q3TZA2 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdkl4Q3TZA2 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdkl4Q3TZA2 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdkl4Q3TZA2 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdkl4Q3TZA2 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdkl4Q3TZA2 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdkl4Q3TZA2 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdkl4Q3TZA2 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdkl4Q3TZA2 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdkl4Q3TZA2 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdkl4Q3TZA2 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdkl4Q3TZA2 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdkl4Q3TZA2 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdkl4Q3TZA2 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdkl4Q3TZA2 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdkl4Q3TZA2 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdkl4Q3TZA2 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdkl4Q3TZA2 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdkl4Q3TZA2 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdkl4Q3TZA2 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdkl4Q3TZA2 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdkl4Q3TZA2 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdkl4Q3TZA2 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdkl4Q3TZA2 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cdkl4Q3TZA2 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cdkl4Q3TZA2 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cdkl4Q3TZA2 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cdkl4Q3TZA2 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cdkl4Q3TZA2 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cdkl4Q3TZA2 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cdkl4Q3TZA2 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cdkl4Q3TZA2 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdkl4Q3TZA2 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdkl4Q3TZA2 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdkl4Q3TZA2 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdkl4Q3TZA2 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdkl4Q3TZA2 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdkl4Q3TZA2 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdkl4Q3TZA2 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdkl4Q3TZA2 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdkl4Q3TZA2 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdkl4Q3TZA2 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdkl4Q3TZA2 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdkl4Q3TZA2 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdkl4Q3TZA2 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdkl4Q3TZA2 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdkl4Q3TZA2 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdkl4Q3TZA2 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdkl4Q3TZA2 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdkl4Q3TZA2 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdkl4Q3TZA2 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdkl4Q3TZA2 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdkl4Q3TZA2 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdkl4Q3TZA2 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdkl4Q3TZA2 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdkl4Q3TZA2 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdkl4Q3TZA2 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdkl4Q3TZA2 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdkl4Q3TZA2 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdkl4Q3TZA2 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdkl4Q3TZA2 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdkl4Q3TZA2 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdkl4Q3TZA2 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdkl4Q3TZA2 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdkl4Q3TZA2 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdkl4Q3TZA2 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdkl4Q3TZA2 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdkl4Q3TZA2 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdkl4Q3TZA2 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdkl4Q3TZA2 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdkl4Q3TZA2 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdkl4Q3TZA2 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdkl4Q3TZA2 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdkl4Q3TZA2 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdkl4Q3TZA2 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdkl4Q3TZA2 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdkl4Q3TZA2 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdkl4Q3TZA2 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdkl4Q3TZA2 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdkl4Q3TZA2 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdkl4Q3TZA2 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdkl4Q3TZA2 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdkl4Q3TZA2 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdkl4Q3TZA2 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdkl4Q3TZA2 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdkl4Q3TZA2 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdkl4Q3TZA2 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdkl4Q3TZA2 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdkl4Q3TZA2 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdkl4Q3TZA2 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdkl4Q3TZA2 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdkl4Q3TZA2 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdkl4Q3TZA2 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdkl4Q3TZA2 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdkl4Q3TZA2 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdkl4Q3TZA2 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdkl4Q3TZA2 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cdkl4Q3TZA2 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cdkl4Q3TZA2 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms