Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYU2

Atp13a5, Probable cation-transporting ATPase 13A5, mousemouse

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a5Q3TYU2 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp13a5Q3TYU2 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp13a5Q3TYU2 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp13a5Q3TYU2 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp13a5Q3TYU2 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp13a5Q3TYU2 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp13a5Q3TYU2 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp13a5Q3TYU2 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp13a5Q3TYU2 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp13a5Q3TYU2 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp13a5Q3TYU2 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp13a5Q3TYU2 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp13a5Q3TYU2 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp13a5Q3TYU2 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp13a5Q3TYU2 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp13a5Q3TYU2 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp13a5Q3TYU2 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp13a5Q3TYU2 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp13a5Q3TYU2 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp13a5Q3TYU2 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp13a5Q3TYU2 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp13a5Q3TYU2 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp13a5Q3TYU2 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp13a5Q3TYU2 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp13a5Q3TYU2 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp13a5Q3TYU2 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp13a5Q3TYU2 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp13a5Q3TYU2 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp13a5Q3TYU2 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp13a5Q3TYU2 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp13a5Q3TYU2 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp13a5Q3TYU2 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp13a5Q3TYU2 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp13a5Q3TYU2 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp13a5Q3TYU2 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp13a5Q3TYU2 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp13a5Q3TYU2 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp13a5Q3TYU2 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp13a5Q3TYU2 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp13a5Q3TYU2 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp13a5Q3TYU2 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp13a5Q3TYU2 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp13a5Q3TYU2 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp13a5Q3TYU2 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp13a5Q3TYU2 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp13a5Q3TYU2 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp13a5Q3TYU2 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp13a5Q3TYU2 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp13a5Q3TYU2 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp13a5Q3TYU2 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atp13a5Q3TYU2 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atp13a5Q3TYU2 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atp13a5Q3TYU2 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atp13a5Q3TYU2 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atp13a5Q3TYU2 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atp13a5Q3TYU2 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atp13a5Q3TYU2 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp13a5Q3TYU2 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp13a5Q3TYU2 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp13a5Q3TYU2 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp13a5Q3TYU2 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp13a5Q3TYU2 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp13a5Q3TYU2 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp13a5Q3TYU2 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp13a5Q3TYU2 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp13a5Q3TYU2 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp13a5Q3TYU2 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp13a5Q3TYU2 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp13a5Q3TYU2 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp13a5Q3TYU2 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp13a5Q3TYU2 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp13a5Q3TYU2 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp13a5Q3TYU2 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp13a5Q3TYU2 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp13a5Q3TYU2 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp13a5Q3TYU2 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp13a5Q3TYU2 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp13a5Q3TYU2 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp13a5Q3TYU2 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp13a5Q3TYU2 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp13a5Q3TYU2 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp13a5Q3TYU2 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp13a5Q3TYU2 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp13a5Q3TYU2 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp13a5Q3TYU2 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp13a5Q3TYU2 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp13a5Q3TYU2 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp13a5Q3TYU2 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp13a5Q3TYU2 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp13a5Q3TYU2 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp13a5Q3TYU2 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp13a5Q3TYU2 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp13a5Q3TYU2 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp13a5Q3TYU2 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp13a5Q3TYU2 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp13a5Q3TYU2 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp13a5Q3TYU2 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp13a5Q3TYU2 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp13a5Q3TYU2 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp13a5Q3TYU2 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms