Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTJ4

Uncharacterized protein C8orf48 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTJ4 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q3TTJ4 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q3TTJ4 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q3TTJ4 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q3TTJ4 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Q3TTJ4 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q3TTJ4 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q3TTJ4 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q3TTJ4 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q3TTJ4 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q3TTJ4 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q3TTJ4 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q3TTJ4 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q3TTJ4 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q3TTJ4 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Q3TTJ4 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Q3TTJ4 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Q3TTJ4 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Q3TTJ4 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Q3TTJ4 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Q3TTJ4 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Q3TTJ4 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Q3TTJ4 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Q3TTJ4 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Q3TTJ4 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q3TTJ4 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q3TTJ4 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q3TTJ4 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q3TTJ4 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q3TTJ4 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Q3TTJ4 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Q3TTJ4 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q3TTJ4 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q3TTJ4 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q3TTJ4 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q3TTJ4 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q3TTJ4 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q3TTJ4 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q3TTJ4 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q3TTJ4 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q3TTJ4 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q3TTJ4 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q3TTJ4 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q3TTJ4 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q3TTJ4 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q3TTJ4 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q3TTJ4 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q3TTJ4 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q3TTJ4 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Q3TTJ4 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q3TTJ4 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q3TTJ4 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q3TTJ4 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q3TTJ4 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q3TTJ4 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q3TTJ4 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q3TTJ4 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q3TTJ4 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q3TTJ4 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q3TTJ4 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q3TTJ4 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q3TTJ4 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Q3TTJ4 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q3TTJ4 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q3TTJ4 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q3TTJ4 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q3TTJ4 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q3TTJ4 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q3TTJ4 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q3TTJ4 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q3TTJ4 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q3TTJ4 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q3TTJ4 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q3TTJ4 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q3TTJ4 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q3TTJ4 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q3TTJ4 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q3TTJ4 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q3TTJ4 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q3TTJ4 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q3TTJ4 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Q3TTJ4 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q3TTJ4 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Q3TTJ4 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q3TTJ4 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q3TTJ4 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q3TTJ4 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q3TTJ4 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q3TTJ4 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q3TTJ4 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q3TTJ4 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q3TTJ4 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q3TTJ4 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q3TTJ4 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q3TTJ4 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q3TTJ4 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q3TTJ4 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q3TTJ4 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q3TTJ4 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Q3TTJ4 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms