Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ctdnep1Q3TP92 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ctdnep1Q3TP92 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ctdnep1Q3TP92 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ctdnep1Q3TP92 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ctdnep1Q3TP92 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ctdnep1Q3TP92 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ctdnep1Q3TP92 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ctdnep1Q3TP92 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ctdnep1Q3TP92 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ctdnep1Q3TP92 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ctdnep1Q3TP92 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ctdnep1Q3TP92 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ctdnep1Q3TP92 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ctdnep1Q3TP92 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ctdnep1Q3TP92 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ctdnep1Q3TP92 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ctdnep1Q3TP92 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ctdnep1Q3TP92 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Ctdnep1Q3TP92 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ctdnep1Q3TP92 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ctdnep1Q3TP92 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ctdnep1Q3TP92 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ctdnep1Q3TP92 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ctdnep1Q3TP92 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ctdnep1Q3TP92 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ctdnep1Q3TP92 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ctdnep1Q3TP92 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ctdnep1Q3TP92 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ctdnep1Q3TP92 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ctdnep1Q3TP92 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ctdnep1Q3TP92 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ctdnep1Q3TP92 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ctdnep1Q3TP92 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ctdnep1Q3TP92 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ctdnep1Q3TP92 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ctdnep1Q3TP92 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ctdnep1Q3TP92 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ctdnep1Q3TP92 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ctdnep1Q3TP92 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ctdnep1Q3TP92 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ctdnep1Q3TP92 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ctdnep1Q3TP92 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ctdnep1Q3TP92 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ctdnep1Q3TP92 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ctdnep1Q3TP92 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ctdnep1Q3TP92 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ctdnep1Q3TP92 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ctdnep1Q3TP92 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ctdnep1Q3TP92 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ctdnep1Q3TP92 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ctdnep1Q3TP92 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Ctdnep1Q3TP92 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ctdnep1Q3TP92 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ctdnep1Q3TP92 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ctdnep1Q3TP92 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ctdnep1Q3TP92 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ctdnep1Q3TP92 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ctdnep1Q3TP92 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ctdnep1Q3TP92 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ctdnep1Q3TP92 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Ctdnep1Q3TP92 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ctdnep1Q3TP92 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ctdnep1Q3TP92 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ctdnep1Q3TP92 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ctdnep1Q3TP92 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ctdnep1Q3TP92 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ctdnep1Q3TP92 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ctdnep1Q3TP92 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ctdnep1Q3TP92 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ctdnep1Q3TP92 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ctdnep1Q3TP92 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ctdnep1Q3TP92 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ctdnep1Q3TP92 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ctdnep1Q3TP92 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ctdnep1Q3TP92 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ctdnep1Q3TP92 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ctdnep1Q3TP92 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ctdnep1Q3TP92 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ctdnep1Q3TP92 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Ctdnep1Q3TP92 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ctdnep1Q3TP92 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ctdnep1Q3TP92 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ctdnep1Q3TP92 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ctdnep1Q3TP92 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ctdnep1Q3TP92 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ctdnep1Q3TP92 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ctdnep1Q3TP92 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ctdnep1Q3TP92 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ctdnep1Q3TP92 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ctdnep1Q3TP92 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ctdnep1Q3TP92 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Ctdnep1Q3TP92 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ctdnep1Q3TP92 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ctdnep1Q3TP92 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ctdnep1Q3TP92 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ctdnep1Q3TP92 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ctdnep1Q3TP92 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ctdnep1Q3TP92 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ctdnep1Q3TP92 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms