Protein–RNA interactions for Protein: Q3TNH5

Fam172a, Protein FAM172A, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam172aQ3TNH5 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fam172aQ3TNH5 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Fam172aQ3TNH5 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fam172aQ3TNH5 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fam172aQ3TNH5 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fam172aQ3TNH5 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fam172aQ3TNH5 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fam172aQ3TNH5 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fam172aQ3TNH5 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fam172aQ3TNH5 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fam172aQ3TNH5 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fam172aQ3TNH5 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fam172aQ3TNH5 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fam172aQ3TNH5 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fam172aQ3TNH5 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fam172aQ3TNH5 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fam172aQ3TNH5 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fam172aQ3TNH5 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fam172aQ3TNH5 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fam172aQ3TNH5 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Fam172aQ3TNH5 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Fam172aQ3TNH5 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fam172aQ3TNH5 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fam172aQ3TNH5 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fam172aQ3TNH5 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fam172aQ3TNH5 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Fam172aQ3TNH5 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Fam172aQ3TNH5 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Fam172aQ3TNH5 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam172aQ3TNH5 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam172aQ3TNH5 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam172aQ3TNH5 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam172aQ3TNH5 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam172aQ3TNH5 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam172aQ3TNH5 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam172aQ3TNH5 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam172aQ3TNH5 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam172aQ3TNH5 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam172aQ3TNH5 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam172aQ3TNH5 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam172aQ3TNH5 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam172aQ3TNH5 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam172aQ3TNH5 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam172aQ3TNH5 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam172aQ3TNH5 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam172aQ3TNH5 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam172aQ3TNH5 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam172aQ3TNH5 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam172aQ3TNH5 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam172aQ3TNH5 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam172aQ3TNH5 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam172aQ3TNH5 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam172aQ3TNH5 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam172aQ3TNH5 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam172aQ3TNH5 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam172aQ3TNH5 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam172aQ3TNH5 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam172aQ3TNH5 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam172aQ3TNH5 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fam172aQ3TNH5 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fam172aQ3TNH5 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fam172aQ3TNH5 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Fam172aQ3TNH5 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fam172aQ3TNH5 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fam172aQ3TNH5 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fam172aQ3TNH5 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fam172aQ3TNH5 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fam172aQ3TNH5 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fam172aQ3TNH5 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fam172aQ3TNH5 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fam172aQ3TNH5 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fam172aQ3TNH5 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Fam172aQ3TNH5 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Fam172aQ3TNH5 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fam172aQ3TNH5 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fam172aQ3TNH5 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Fam172aQ3TNH5 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fam172aQ3TNH5 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fam172aQ3TNH5 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Fam172aQ3TNH5 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fam172aQ3TNH5 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam172aQ3TNH5 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam172aQ3TNH5 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam172aQ3TNH5 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam172aQ3TNH5 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam172aQ3TNH5 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam172aQ3TNH5 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam172aQ3TNH5 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam172aQ3TNH5 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam172aQ3TNH5 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam172aQ3TNH5 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam172aQ3TNH5 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam172aQ3TNH5 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam172aQ3TNH5 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam172aQ3TNH5 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam172aQ3TNH5 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam172aQ3TNH5 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam172aQ3TNH5 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam172aQ3TNH5 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam172aQ3TNH5 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms