Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc10Q3TLI0 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc10Q3TLI0 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc10Q3TLI0 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc10Q3TLI0 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc10Q3TLI0 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc10Q3TLI0 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc10Q3TLI0 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc10Q3TLI0 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc10Q3TLI0 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trappc10Q3TLI0 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trappc10Q3TLI0 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trappc10Q3TLI0 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trappc10Q3TLI0 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trappc10Q3TLI0 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trappc10Q3TLI0 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trappc10Q3TLI0 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trappc10Q3TLI0 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trappc10Q3TLI0 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trappc10Q3TLI0 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trappc10Q3TLI0 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trappc10Q3TLI0 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trappc10Q3TLI0 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Trappc10Q3TLI0 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trappc10Q3TLI0 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trappc10Q3TLI0 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trappc10Q3TLI0 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trappc10Q3TLI0 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trappc10Q3TLI0 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Trappc10Q3TLI0 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trappc10Q3TLI0 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Trappc10Q3TLI0 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trappc10Q3TLI0 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trappc10Q3TLI0 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trappc10Q3TLI0 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trappc10Q3TLI0 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trappc10Q3TLI0 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trappc10Q3TLI0 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trappc10Q3TLI0 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trappc10Q3TLI0 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trappc10Q3TLI0 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trappc10Q3TLI0 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trappc10Q3TLI0 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trappc10Q3TLI0 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trappc10Q3TLI0 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trappc10Q3TLI0 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trappc10Q3TLI0 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trappc10Q3TLI0 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trappc10Q3TLI0 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trappc10Q3TLI0 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trappc10Q3TLI0 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trappc10Q3TLI0 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trappc10Q3TLI0 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trappc10Q3TLI0 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trappc10Q3TLI0 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Trappc10Q3TLI0 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trappc10Q3TLI0 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Trappc10Q3TLI0 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trappc10Q3TLI0 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trappc10Q3TLI0 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trappc10Q3TLI0 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trappc10Q3TLI0 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trappc10Q3TLI0 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trappc10Q3TLI0 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trappc10Q3TLI0 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trappc10Q3TLI0 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trappc10Q3TLI0 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trappc10Q3TLI0 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trappc10Q3TLI0 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trappc10Q3TLI0 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trappc10Q3TLI0 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trappc10Q3TLI0 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Trappc10Q3TLI0 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trappc10Q3TLI0 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trappc10Q3TLI0 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trappc10Q3TLI0 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trappc10Q3TLI0 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trappc10Q3TLI0 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trappc10Q3TLI0 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trappc10Q3TLI0 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trappc10Q3TLI0 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trappc10Q3TLI0 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trappc10Q3TLI0 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trappc10Q3TLI0 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trappc10Q3TLI0 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trappc10Q3TLI0 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trappc10Q3TLI0 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trappc10Q3TLI0 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trappc10Q3TLI0 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trappc10Q3TLI0 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trappc10Q3TLI0 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trappc10Q3TLI0 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trappc10Q3TLI0 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trappc10Q3TLI0 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trappc10Q3TLI0 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc10Q3TLI0 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc10Q3TLI0 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc10Q3TLI0 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc10Q3TLI0 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc10Q3TLI0 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms