Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 408 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccbe1Q3MI99 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccbe1Q3MI99 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccbe1Q3MI99 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccbe1Q3MI99 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccbe1Q3MI99 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccbe1Q3MI99 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccbe1Q3MI99 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccbe1Q3MI99 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccbe1Q3MI99 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccbe1Q3MI99 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccbe1Q3MI99 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccbe1Q3MI99 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccbe1Q3MI99 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccbe1Q3MI99 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccbe1Q3MI99 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccbe1Q3MI99 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccbe1Q3MI99 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccbe1Q3MI99 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccbe1Q3MI99 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccbe1Q3MI99 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccbe1Q3MI99 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccbe1Q3MI99 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccbe1Q3MI99 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccbe1Q3MI99 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccbe1Q3MI99 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccbe1Q3MI99 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccbe1Q3MI99 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccbe1Q3MI99 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccbe1Q3MI99 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccbe1Q3MI99 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccbe1Q3MI99 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccbe1Q3MI99 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccbe1Q3MI99 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccbe1Q3MI99 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccbe1Q3MI99 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccbe1Q3MI99 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccbe1Q3MI99 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccbe1Q3MI99 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccbe1Q3MI99 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccbe1Q3MI99 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccbe1Q3MI99 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccbe1Q3MI99 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccbe1Q3MI99 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccbe1Q3MI99 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccbe1Q3MI99 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccbe1Q3MI99 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccbe1Q3MI99 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccbe1Q3MI99 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccbe1Q3MI99 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccbe1Q3MI99 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccbe1Q3MI99 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccbe1Q3MI99 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccbe1Q3MI99 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccbe1Q3MI99 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccbe1Q3MI99 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccbe1Q3MI99 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccbe1Q3MI99 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccbe1Q3MI99 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccbe1Q3MI99 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccbe1Q3MI99 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccbe1Q3MI99 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccbe1Q3MI99 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccbe1Q3MI99 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccbe1Q3MI99 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccbe1Q3MI99 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccbe1Q3MI99 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccbe1Q3MI99 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccbe1Q3MI99 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccbe1Q3MI99 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccbe1Q3MI99 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccbe1Q3MI99 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccbe1Q3MI99 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccbe1Q3MI99 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccbe1Q3MI99 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccbe1Q3MI99 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccbe1Q3MI99 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccbe1Q3MI99 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccbe1Q3MI99 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccbe1Q3MI99 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccbe1Q3MI99 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccbe1Q3MI99 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccbe1Q3MI99 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccbe1Q3MI99 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccbe1Q3MI99 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccbe1Q3MI99 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccbe1Q3MI99 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccbe1Q3MI99 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccbe1Q3MI99 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccbe1Q3MI99 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccbe1Q3MI99 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccbe1Q3MI99 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccbe1Q3MI99 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccbe1Q3MI99 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccbe1Q3MI99 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccbe1Q3MI99 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccbe1Q3MI99 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccbe1Q3MI99 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccbe1Q3MI99 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccbe1Q3MI99 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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